A systematic evaluation of nucleotide properties for CRISPR sgRNA design.

Kuan, Pei Fen; Powers, Scott; He, Shuyao; Li, Kaiqiao; Zhao, Xiaoyu; Huang, Bo

Kuan, Pei Fen; Powers, Scott; He, Shuyao; Li, Kaiqiao; Zhao, Xiaoyu; Huang, Bo.

Afiliação

Kuan PF; Department of Applied Mathematics and Statistics, Stony Brook University, 100 Nicolls Road, Stony Brook, 11794, USA. peifen.kuan@stonybrook.edu.
Powers S; Department of Pathology, Stony Brook University, 100 Nicolls Road, Stony Brook, 11794, USA.
He S; Department of Applied Mathematics and Statistics, Stony Brook University, 100 Nicolls Road, Stony Brook, 11794, USA.
Li K; Department of Applied Mathematics and Statistics, Stony Brook University, 100 Nicolls Road, Stony Brook, 11794, USA.
Zhao X; Department of Pathology, Stony Brook University, 100 Nicolls Road, Stony Brook, 11794, USA.
Huang B; Oncology Business Unit, Pfizer Inc., 558 Eastern Point Rd, Groton, 06340, USA.

BMC Bioinformatics ; 18(1): 297, 2017 Jun 06.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28587596

Assuntos

Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas/genética; Nucleotídeos/metabolismo; Interface Usuário-Computador; Animais; Área Sob a Curva; Edição de Genes; Internet; Aprendizado de Máquina; Curva ROC; Termodinâmica

Palavras-chave

CRISPR; Machine learning; Predictive modeling; Thermodynamics

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Interface Usuário-Computador / Repetições Palindrômicas Curtas Agrupadas e Regularmente Espaçadas / Nucleotídeos Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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