Rapid Nanopore Sequencing of Plasmids and Resistance Gene Detection in Clinical Isolates.

Lemon, Jamie K; Khil, Pavel P; Frank, Karen M; Dekker, John P

Lemon, Jamie K; Khil, Pavel P; Frank, Karen M; Dekker, John P.

Afiliação

Lemon JK; Microbiology Service, Department of Laboratory Medicine, Clinical Center, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA.
Khil PP; Microbiology Service, Department of Laboratory Medicine, Clinical Center, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA.
Frank KM; Microbiology Service, Department of Laboratory Medicine, Clinical Center, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA.
Dekker JP; Microbiology Service, Department of Laboratory Medicine, Clinical Center, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA john.dekker@nih.gov.

J Clin Microbiol ; 55(12): 3530-3543, 2017 12.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29021151

Assuntos

Farmacorresistência Bacteriana; Escherichia coli/genética; Genes Bacterianos; Klebsiella pneumoniae/genética; Testes de Sensibilidade Microbiana/métodos; Plasmídeos; Análise de Sequência de DNA/métodos; Infecções Bacterianas/diagnóstico; Infecções Bacterianas/microbiologia; Escherichia coli/isolamento & purificação; Klebsiella pneumoniae/isolamento & purificação; Nanoporos; Fatores de Tempo; Fluxo de Trabalho

Palavras-chave

MinION; antibiotic resistance; genomics; nanopore; plasmids

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Plasmídeos / Testes de Sensibilidade Microbiana / Análise de Sequência de DNA / Farmacorresistência Bacteriana / Escherichia coli / Genes Bacterianos / Klebsiella pneumoniae Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Evaluation_studies / Prognostic_studies Idioma: En Revista: J Clin Microbiol Ano de publicação: 2017 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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