ChopStitch: exon annotation and splice graph construction using transcriptome assembly and whole genome sequencing data.

Khan, Hamza; Mohamadi, Hamid; Vandervalk, Benjamin P; Warren, Rene L; Chu, Justin; Birol, Inanc

Khan, Hamza; Mohamadi, Hamid; Vandervalk, Benjamin P; Warren, Rene L; Chu, Justin; Birol, Inanc.

Afiliação

Khan H; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Mohamadi H; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Vandervalk BP; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Warren RL; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Chu J; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.
Birol I; Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre, British Columbia Cancer Agency, Vancouver, BC V5Z 4S6, Canada.

Bioinformatics ; 34(10): 1697-1704, 2018 05 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-29300846

Assuntos

Processamento Alternativo; Éxons; Transcriptoma; Sequenciamento Completo do Genoma; Algoritmos; Genoma; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; RNA; Análise de Sequência de RNA/métodos; Software

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Éxons / Processamento Alternativo / Transcriptoma / Sequenciamento Completo do Genoma Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Canadá

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