TNER: a novel background error suppression method for mutation detection in circulating tumor DNA.

Deng, Shibing; Lira, Maruja; Huang, Donghui; Wang, Kai; Valdez, Crystal; Kinong, Jennifer; Rejto, Paul A; Bienkowska, Jadwiga; Hardwick, James; Xie, Tao

Deng, Shibing; Lira, Maruja; Huang, Donghui; Wang, Kai; Valdez, Crystal; Kinong, Jennifer; Rejto, Paul A; Bienkowska, Jadwiga; Hardwick, James; Xie, Tao.

Afiliação

Deng S; Pfizer Early Clinical Development Biostatistics, Cambridge, UK.
Lira M; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Huang D; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Wang K; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Valdez C; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Kinong J; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Rejto PA; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Bienkowska J; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Hardwick J; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA.
Xie T; Pfizer Oncology R & D, San Diego, CA, USA. xietao2000@gmail.com.

BMC Bioinformatics ; 19(1): 387, 2018 Oct 20.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-30342468

Assuntos

DNA Tumoral Circulante/genética; Análise Mutacional de DNA/métodos; Mutação/genética; Simulação por Computador; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Humanos; Neoplasias/genética; Distribuição Normal; Curva ROC; Software

Palavras-chave

Error suppression; Next-generation sequencing; Single-nucleotide variant; Variant calling; ctDNA

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise Mutacional de DNA / DNA Tumoral Circulante / Mutação Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Prognostic_studies / Screening_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Reino Unido

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