Effective Surveillance Using Multilocus Variable-Number Tandem-Repeat Analysis and Whole-Genome Sequencing for Enterohemorrhagic Escherichia coli O157.

Lee, Kenichi; Izumiya, Hidemasa; Iyoda, Sunao; Ohnishi, Makoto

Lee, Kenichi; Izumiya, Hidemasa; Iyoda, Sunao; Ohnishi, Makoto.

Afiliação

Lee K; Department of Bacteriology I, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan leek@niid.go.jp.
Izumiya H; Department of Bacteriology I, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan.
Iyoda S; Department of Bacteriology I, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan.
Ohnishi M; Department of Bacteriology I, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan.

Appl Environ Microbiol ; 85(17)2019 09 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31227555

Assuntos

Surtos de Doenças; Monitoramento Epidemiológico; Infecções por Escherichia coli/epidemiologia; Escherichia coli O157/isolamento & purificação; Genoma Bacteriano; Tipagem de Sequências Multilocus/métodos; Sequenciamento Completo do Genoma/métodos; Simulação por Computador; Infecções por Escherichia coli/microbiologia; Escherichia coli O157/genética; Repetições Minissatélites; Polimorfismo de Nucleotídeo Único

Palavras-chave

core genome SNP analysis; core genome multilocus sequence typing; enterohemorrhagic Escherichia coli; multilocus variable-number tandem-repeat analysis; whole-genome sequencing

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Surtos de Doenças / Genoma Bacteriano / Escherichia coli O157 / Infecções por Escherichia coli / Tipagem de Sequências Multilocus / Monitoramento Epidemiológico / Sequenciamento Completo do Genoma Tipo de estudo: Prognostic_studies / Screening_studies Idioma: En Revista: Appl Environ Microbiol Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Japão

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