MS-EmpiRe Utilizes Peptide-level Noise Distributions for Ultra-sensitive Detection of Differentially Expressed Proteins.

Ammar, Constantin; Gruber, Markus; Csaba, Gergely; Zimmer, Ralf

Ammar, Constantin; Gruber, Markus; Csaba, Gergely; Zimmer, Ralf.

Afiliação

Ammar C; Ludwig-Maximilians-Universität München, Department of Informatics, Amalienstrasse 17, 80333 München, Germany; §Graduate School of Quantitative Biosciences (QBM), Ludwig-Maximillians-Universität München, Feodor-Lynen-Strasse 25, 81377 Munich, Germany.
Gruber M; Ludwig-Maximilians-Universität München, Department of Informatics, Amalienstrasse 17, 80333 München, Germany.
Csaba G; Ludwig-Maximilians-Universität München, Department of Informatics, Amalienstrasse 17, 80333 München, Germany.
Zimmer R; Ludwig-Maximilians-Universität München, Department of Informatics, Amalienstrasse 17, 80333 München, Germany; §Graduate School of Quantitative Biosciences (QBM), Ludwig-Maximillians-Universität München, Feodor-Lynen-Strasse 25, 81377 Munich, Germany. Electronic address: zimmer@ifi.lmu.de.

Mol Cell Proteomics ; 18(9): 1880-1892, 2019 09.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31235637

Assuntos

Espectrometria de Massas/métodos; Peptídeos/análise; Proteoma/análise; Proteômica/métodos; Software; Doença de Alzheimer/metabolismo; Benchmarking; Bases de Dados Factuais; Francisella/metabolismo; Proteínas Fúngicas/análise; Células HeLa; Humanos; Doença de Parkinson/metabolismo; Proteínas de Plantas/análise; Reprodutibilidade dos Testes; Razão Sinal-Ruído

Palavras-chave

Quantification; TMT; bioinformatics; bioinformatics software; differential expression; differential quantification; label-free quantification; mass spectrometry; statistics

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Peptídeos / Espectrometria de Massas / Software / Proteoma / Proteômica Tipo de estudo: Diagnostic_studies / Guideline / Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Mol Cell Proteomics Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / BIOQUIMICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: Alemanha

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google