Fine-grained alignment of cryo-electron subtomograms based on MPI parallel optimization.

Lü, Yongchun; Zeng, Xiangrui; Zhao, Xiaofang; Li, Shirui; Li, Hua; Gao, Xin; Xu, Min

Lü, Yongchun; Zeng, Xiangrui; Zhao, Xiaofang; Li, Shirui; Li, Hua; Gao, Xin; Xu, Min.

Afiliação

Lü Y; University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China. lvyongchun@ncic.ac.cn.
Zeng X; Institute of Computing Technology of the Chinese Academy of Sciences, Beijing, China. lvyongchun@ncic.ac.cn.
Zhao X; Key Laboratory of Intelligent Information Processing, CAS, Beijing, China. lvyongchun@ncic.ac.cn.
Li S; Computational Biology Department, School of Computer Science, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, USA.
Li H; University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.
Gao X; Institute of Computing Technology of the Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.
Xu M; Institute of Computing Technology of the Chinese Academy of Sciences, Beijing, China.

BMC Bioinformatics ; 20(1): 443, 2019 Aug 28.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-31455212

Assuntos

Algoritmos; Microscopia Crioeletrônica/métodos; Tomografia com Microscopia Eletrônica/métodos; Chaperonina 10/ultraestrutura; Chaperonina 60/ultraestrutura; Bases de Dados de Proteínas; Processamento de Imagem Assistida por Computador/métodos; Razão Sinal-Ruído; Fatores de Tempo

Palavras-chave

Cryo-ET; Fine-grained alignment; MPI; Stochastic average gradient

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Microscopia Crioeletrônica / Tomografia com Microscopia Eletrônica Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2019 Tipo de documento: Article País de afiliação: China

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar no Google