A network-based computational framework to predict and differentiate functions for gene isoforms using exon-level expression data.

Wang, Dingjie; Zou, Xiufen; Fai Au, Kin

Wang, Dingjie; Zou, Xiufen; Fai Au, Kin.

Afiliação

Wang D; Department of Biomedical Informatics, The Ohio State University, OH 43210, USA; School of Mathematics and Statistics, Wuhan University, Wuhan 430072, China; Computational Science Hubei Key Laboratory, Wuhan University, Wuhan 430072, China.
Zou X; School of Mathematics and Statistics, Wuhan University, Wuhan 430072, China; Computational Science Hubei Key Laboratory, Wuhan University, Wuhan 430072, China. Electronic address: xfzou@whu.edu.cn.
Fai Au K; Department of Biomedical Informatics, The Ohio State University, OH 43210, USA. Electronic address: kinfai.au@osumc.edu.

Methods ; 189: 54-64, 2021 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32534132

Assuntos

Processamento Alternativo; Biologia Computacional/métodos; Éxons; Redes Neurais de Computação; Isoformas de Proteínas; Software; Regulação da Expressão Gênica; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Humanos; Análise de Sequência de RNA

Palavras-chave

Alternative splicing; Co-expression networks; Exon-level RNA-Seq; Gene isoforms; Matrix Correlation

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Éxons / Redes Neurais de Computação / Processamento Alternativo / Biologia Computacional / Isoformas de Proteínas Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Methods Assunto da revista: BIOQUIMICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: China

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