scAPAtrap: identification and quantification of alternative polyadenylation sites from single-cell RNA-seq data.

Wu, Xiaohui; Liu, Tao; Ye, Congting; Ye, Wenbin; Ji, Guoli

Wu, Xiaohui; Liu, Tao; Ye, Congting; Ye, Wenbin; Ji, Guoli.

Afiliação

Wu X; Department of Automation in Xiamen University.
Liu T; Department of Automation in Xiamen University.
Ye C; College of the Environment and Ecology in Xiamen University.
Ye W; Department of Automation in Xiamen University.
Ji G; Department of Automation in Xiamen University.

Brief Bioinform ; 22(4)2021 07 20.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33142319

Assuntos

Bases de Dados de Ácidos Nucleicos; Genoma; Sinais de Poliadenilação na Ponta 3' do RNA; RNA-Seq; Análise de Célula Única; Software; Anotação de Sequência Molecular

Palavras-chave

3' untranslated region; RNA processing; alternative polyadenylation; single-cell RNA-seq; software

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Genoma / Bases de Dados de Ácidos Nucleicos / Sinais de Poliadenilação na Ponta 3' do RNA / Análise de Célula Única / RNA-Seq Tipo de estudo: Diagnostic_studies Idioma: En Revista: Brief Bioinform Assunto da revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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