AlignGraph2: similar genome-assisted reassembly pipeline for PacBio long reads.

Huang, Shien; He, Xinyu; Wang, Guohua; Bao, Ergude

Huang, Shien; He, Xinyu; Wang, Guohua; Bao, Ergude.

Afiliação

Huang S; Group of Interdisciplinary Information Sciences, School of Software Engineering, Beijing Jiaotong University, China.
He X; Group of Interdisciplinary Information Sciences, School of Software Engineering, Beijing Jiaotong University, China.
Wang G; College of Information and Computer Engineering, Northeast Forestry University, China.
Bao E; Interdisciplinary Information Sciences, School of Software Engineering, Beijing Jiaotong University, China.

Brief Bioinform ; 22(5)2021 09 02.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-33621981

Assuntos

Algoritmos; Arabidopsis/genética; Ilhas de CpG/genética; Genoma Fúngico; Genoma Humano; Genoma de Planta; Saccharomyces cerevisiae/genética; Alinhamento de Sequência/métodos; Software; Mapeamento de Sequências Contíguas/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Humanos; Sequenciamento Completo do Genoma/métodos

Palavras-chave

de Brujin graph; genome assembly; similar genome

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Saccharomyces cerevisiae / Algoritmos / Software / Genoma Humano / Alinhamento de Sequência / Genoma Fúngico / Arabidopsis / Genoma de Planta / Ilhas de CpG Tipo de estudo: Evaluation_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Brief Bioinform Assunto da revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: China

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