Separating the Wheat from the Chaff: The Use of Upstream Regulator Analysis to Identify True Differential Expression of Single Genes within Transcriptomic Datasets.

Hadwen, Jeremiah; Schock, Sarah; Farooq, Faraz; MacKenzie, Alex; Plaza-Diaz, Julio

Hadwen, Jeremiah; Schock, Sarah; Farooq, Faraz; MacKenzie, Alex; Plaza-Diaz, Julio.

Afiliação

Hadwen J; Department of Cellular and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, University of Ottawa, Ottawa, ON K1H8M5, Canada.
Schock S; Children's Hospital of Eastern Ontario Research Institute, Ottawa, ON K1H8L1, Canada.
Farooq F; Department of Cellular and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, University of Ottawa, Ottawa, ON K1H8M5, Canada.
MacKenzie A; Children's Hospital of Eastern Ontario Research Institute, Ottawa, ON K1H8L1, Canada.
Plaza-Diaz J; Department of Cellular and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, University of Ottawa, Ottawa, ON K1H8M5, Canada.

Int J Mol Sci ; 22(12)2021 Jun 11.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34208365

Assuntos

Bases de Dados Genéticas; Sequências Reguladoras de Ácido Nucleico/genética; Transcriptoma/genética; Animais; Linhagem Celular Tumoral; Regulação para Baixo/efeitos dos fármacos; Regulação para Baixo/genética; Redes Reguladoras de Genes/efeitos dos fármacos; Masculino; Camundongos Endogâmicos C57BL; Reprodutibilidade dos Testes; Tiroxina/farmacologia; Transcriptoma/efeitos dos fármacos

Palavras-chave

differential expression analysis; drug repurposing; rare disease; transcriptomics

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Sequências Reguladoras de Ácido Nucleico / Bases de Dados Genéticas / Transcriptoma Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Animals Idioma: En Revista: Int J Mol Sci Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Canadá

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