Trust your guts? The effect of gut section on diet composition and impact of Mus musculus on islands using metabarcoding.

RESUMO

O metabarcoding de ADN é amplamente utilizado para a caracterização da dieta de espécies, e tornou­se bastante relevante para a conservação da biodiversidade, permitindo a compreensão sobre cadeias tróficas e o impacto de espécies invasoras. A necessidade de métodos de monitorização da biodiversidade com uma boa relação custo­benefício fomentaram avanços nesta técnica. Uma questão que se coloca é qual o tipo de amostra que fornece uma melhor representação da dieta. Deste modo, com este estudo, pretendemos avaliar se existem diferenças nas estimativas da dieta de acordo com a secção do tracto gastrointestinal analisada e qual(is) a(s) secção(ões) que proporciona(m) uma melhor representação da dieta. Adicionalmente, pretendemos inferir os impactos ecológicos/ económicos de um invasor como um modelo dos efeitos potenciais que este pode ter num ecossistema originalmente sem mamíferos. Analisámos os conteúdos gastrointestinais do rato doméstico Mus musculus introduzido em Cabo Verde, considerando três secções: estômago, intestino delgado e intestino grosso. Aplicámos uma abordagem de metabarcoding de ADN usando dois marcadores genéticos, um específico para plantas e outro para invertebrados. Mostrámos que este invasor consumiu 131 taxa (73 plantas e 58 invertebrados). Obtivemos diferenças significativas na composição de duas das três secções, com maior incidência de invertebrados no estômago e de plantas nos intestinos. Isto pode dever­se a inibidores estomacais que agem sobre as plantas e/ ou à absorção mais rápida de invertebrados de corpo mole em comparação com as fibras vegetais nos intestinos. Verificámos que o impacto deste invasor no ecossistema é predominantemente negativo, pois pelo menos 50% dos itens ingeridos eram nativos, endémicos ou economicamente importantes e apenas 19% dos itens da dieta eram exóticos. De modo geral, os resultados mostraram a necessidade de analisar apenas duas secções do tracto gastrointestinal para obter dados robustos da dieta, aumentando a relação custo­eficácia deste método. Além disso, ao descobrir os taxa nativos mais frequentemente predados por ratos, a abordagem de metabarcoding de ADN permitiu­nos avaliar com eficiência quais estão sob maior risco.