rprimer: an R/bioconductor package for design of degenerate oligos for sequence variable viruses.

Persson, Sofia; Larsson, Christina; Simonsson, Magnus; Ellström, Patrik

Persson, Sofia; Larsson, Christina; Simonsson, Magnus; Ellström, Patrik.

Afiliação

Persson S; European Union Reference Laboratory for Foodborne Viruses, Swedish Food Agency, Dag Hammarskjölds väg 56 A, 752 37, Uppsala, Sweden. sofia.persson@slv.se.
Larsson C; Department of Medical Sciences, Zoonosis Science Centre, Uppsala University, Uppsala, Sweden. sofia.persson@slv.se.
Simonsson M; Section of Clinical Virology, Department of Medical Sciences, Uppsala University, Uppsala, Sweden.
Ellström P; European Union Reference Laboratory for Foodborne Viruses, Swedish Food Agency, Dag Hammarskjölds väg 56 A, 752 37, Uppsala, Sweden.

BMC Bioinformatics ; 23(1): 239, 2022 Jun 18.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35717145

Assuntos

Norovirus; Primers do DNA/genética; Norovirus/genética; Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real/métodos; Alinhamento de Sequência

Palavras-chave

Degenerate primers; Digital PCR; Genotyping; Norovirus; PCR; Primer design; RT-PCR; Sequence variable virus; qPCR

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Norovirus Tipo de estudo: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article País de afiliação: Suécia

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