Quantitative Comparison of Multiple Chromatin Immunoprecipitation-Sequencing (ChIP-seq) Experiments with spikChIP.

Blanco, Enrique; Ballaré, Cecilia; Di Croce, Luciano; Aranda, Sergi

Blanco, Enrique; Ballaré, Cecilia; Di Croce, Luciano; Aranda, Sergi.

Afiliação

Blanco E; Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology, Barcelona, Spain.
Ballaré C; Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology, Barcelona, Spain.
Di Croce L; Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology, Barcelona, Spain. Luciano.DiCroce@crg.eu.
Aranda S; Universitat Pompeu Fabra (UPF), Barcelona, Spain. Luciano.DiCroce@crg.eu.

Methods Mol Biol ; 2624: 55-72, 2023.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-36723809

Assuntos

Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação; Histonas; Animais; Histonas/genética; Histonas/metabolismo; Drosophila melanogaster/genética; Drosophila melanogaster/metabolismo; Cromatina/genética; Imunoprecipitação da Cromatina/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Análise de Sequência de DNA/métodos

Palavras-chave

ChIP peak; ChIP-seq; Chromatin; Genome bin; Local regression; Normalization; Spike-in

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Histonas / Sequenciamento de Cromatina por Imunoprecipitação Limite: Animals Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article País de afiliação: Espanha

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