nPoRe: n-polymer realigner for improved pileup-based variant calling.

Dunn, Tim; Blaauw, David; Das, Reetuparna; Narayanasamy, Satish

Dunn, Tim; Blaauw, David; Das, Reetuparna; Narayanasamy, Satish.

Afiliação

Dunn T; University of Michigan, Ann Arbor, USA. timdunn@umich.edu.
Blaauw D; University of Michigan, Ann Arbor, USA.
Das R; University of Michigan, Ann Arbor, USA.
Narayanasamy S; University of Michigan, Ann Arbor, USA.

BMC Bioinformatics ; 24(1): 98, 2023 Mar 16.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-36927439

Assuntos

Algoritmos; Software; Análise de Sequência de DNA; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Mutação INDEL; Polimorfismo de Nucleotídeo Único

Palavras-chave

Alignment; Copy number; Germline variant calling; Homopolymer; N-polymer; Nanopore sequencing; Short tandem repeat; Variable gap penalty

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Algoritmos / Software Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

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