PanDelos-frags: A methodology for discovering pangenomic content of incomplete microbial assemblies.

Bonnici, Vincenzo; Mengoni, Claudia; Mangoni, Manuel; Franco, Giuditta; Giugno, Rosalba

Bonnici, Vincenzo; Mengoni, Claudia; Mangoni, Manuel; Franco, Giuditta; Giugno, Rosalba.

Afiliação

Bonnici V; Department of Mathematical, Physical and Computer Sciences, University of Parma, Parco Area delle Scienze 53/a (Campus), Parma, 43124, PR, Italy. Electronic address: vincenzo.bonnici@unipr.it.
Mengoni C; Department of Computer Science, University of Verona, Strada le Grazie, 15, Verona, 37134, VR, Italy.
Mangoni M; Fondazione IRCCS Casa Sollievo della Sofferenza, San Giovanni Rotondo (FG), 71013, Italy; Department of Experimental Medicine, Sapienza University of Rome, Rome (RM), Italy.
Franco G; Department of Computer Science, University of Verona, Strada le Grazie, 15, Verona, 37134, VR, Italy.
Giugno R; Department of Computer Science, University of Verona, Strada le Grazie, 15, Verona, 37134, VR, Italy.

J Biomed Inform ; 148: 104552, 2023 Dec.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-37995844

Assuntos

Genômica; Microbiota; Humanos; Ecossistema; Genoma; Genômica/métodos; Metagenômica/métodos; Software; Microbiota/genética

Palavras-chave

Computational approach; Fragmented genomes; Gene families; Pangenome; Sequence homology

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genômica / Microbiota Limite: Humans Idioma: En Revista: J Biomed Inform Assunto da revista: INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article

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