Detalles de la búsqueda
1.
Simple and efficient profiling of transcription initiation and transcript levels with STRIPE-seq.
Genome Res
; 30(6): 910-923, 2020 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32660958
2.
SRAssembler: Selective Recursive local Assembly of homologous genomic regions.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 371, 2019 Jul 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31266441
3.
Changes in gene DNA methylation and expression networks accompany caste specialization and age-related physiological changes in a social insect.
Mol Ecol
; 28(8): 1975-1993, 2019 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30809873
4.
xGDBvm: A Web GUI-Driven Workflow for Annotating Eukaryotic Genomes in the Cloud.
Plant Cell
; 28(4): 840-54, 2016 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27020957
5.
Genome, transcriptome and methylome sequencing of a primitively eusocial wasp reveal a greatly reduced DNA methylation system in a social insect.
Mol Ecol
; 25(8): 1769-84, 2016 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26859767
6.
Discovery and expression analysis of alternative splicing events conserved among plant SR proteins.
Mol Biol Evol
; 31(3): 605-13, 2014 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24356560
7.
TAL Effector-Nucleotide Targeter (TALE-NT) 2.0: tools for TAL effector design and target prediction.
Nucleic Acids Res
; 40(Web Server issue): W117-22, 2012 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22693217
8.
From small RNA discoveries to a new paradigm in computational genomics?
New Phytol
; 220(3): 659-660, 2018 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30324739
9.
Genome-wide distribution of transposed Dissociation elements in maize.
Plant Cell
; 22(6): 1667-85, 2010 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20581308
10.
The BioExtract Server: a web-based bioinformatic workflow platform.
Nucleic Acids Res
; 39(Web Server issue): W528-32, 2011 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21546552
11.
ParsEval: parallel comparison and analysis of gene structure annotations.
BMC Bioinformatics
; 13: 187, 2012 Aug 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22852583
12.
Tools and applications for integrative analysis of DNA methylation in social insects.
Mol Ecol Resour
; 22(4): 1656-1674, 2022 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34861105
13.
iLoci: robust evaluation of genome content and organization for provisional and mature genome assemblies.
NAR Genom Bioinform
; 4(1): lqac013, 2022 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35211671
14.
Two new complete genome sequences offer insight into host and tissue specificity of plant pathogenic Xanthomonas spp.
J Bacteriol
; 193(19): 5450-64, 2011 Oct.
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| MEDLINE | ID: mdl-21784931
15.
Common introns within orthologous genes: software and application to plants.
Brief Bioinform
; 10(6): 631-44, 2009 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19933210
16.
Flexible analysis of TSS mapping data and detection of TSS shifts with TSRexploreR.
NAR Genom Bioinform
; 3(2): lqab051, 2021 Jun.
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| MEDLINE | ID: mdl-34250478
17.
The Xa7 resistance gene guards the rice susceptibility gene SWEET14 against exploitation by the bacterial blight pathogen.
Plant Commun
; 2(3): 100164, 2021 05 10.
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| MEDLINE | ID: mdl-34027391
18.
Regional mutagenesis using Dissociation in maize.
Methods
; 49(3): 248-54, 2009 Nov.
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| MEDLINE | ID: mdl-19394430
19.
Using RAMPAGE to Identify and Annotate Promoters in Insect Genomes.
Methods Mol Biol
; 1858: 99-116, 2019.
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| MEDLINE | ID: mdl-30414114
20.
Promoter Architecture and Sex-Specific Gene Expression in Daphnia pulex.
Genetics
; 204(2): 593-612, 2016 Oct.
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| MEDLINE | ID: mdl-27585846