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1.

Poor Diagnostic Reproducibility in the Identification of Nonconventional Dysplasia in Colitis Impacts the Application of Histologic Stratification Tools.

Nasreddin, Nadia; Jansen, Marnix; Loughrey, Maurice B; Wang, Lai Mun; Koelzer, Viktor H; Rodriguez-Justo, Manuel; Novelli, Marco; Fisher, Jennifer; Brown, Matthew W; Al Bakir, Ibrahim; Hart, Ailsa L; Dunne, Philip; Graham, Trevor A; Leedham, Simon J.

Mod Pathol ; 37(3): 100419, 2024 Mar.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38158125

2.

PhyloFisher: A phylogenomic package for resolving eukaryotic relationships.

Tice, Alexander K; Zihala, David; Pánek, Tomás; Jones, Robert E; Salomaki, Eric D; Nenarokov, Serafim; Burki, Fabien; Eliás, Marek; Eme, Laura; Roger, Andrew J; Rokas, Antonis; Shen, Xing-Xing; Strassert, Jürgen F H; Kolísko, Martin; Brown, Matthew W.

PLoS Biol ; 19(8): e3001365, 2021 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34358228

3.

Isolation of Naegleria lustrarea n. sp. (Excavata, Discoba, Heterolobosea) from the feces of Ambystoma annulatum (Ringed Salamander) in Northwest Arkansas.

Becker, Brian M; Banson, Idan; Walker, James M; Deshwal, Anant; Brown, Matthew W; Silberman, Jeffery D.

J Eukaryot Microbiol ; : e13031, 2024 May 09.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38725295

4.

Living in the cracks: Two novel genera of Variosea (Amoebozoa) discovered on an urban sidewalk.

Fry, Nicholas; Schuler, Gabriel A; Jones, Robert E; Kooienga, Peter G; Jira, Violet; Shepherd, Maggie; Tice, Alexander K; Brown, Matthew W.

J Eukaryot Microbiol ; 71(3): e13020, 2024.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38240465

5.

An Enigmatic Stramenopile Sheds Light on Early Evolution in Ochrophyta Plastid Organellogenesis.

Azuma, Tomonori; Pánek, Tomás; Tice, Alexander K; Kayama, Motoki; Kobayashi, Mayumi; Miyashita, Hideaki; Suzaki, Toshinobu; Yabuki, Akinori; Brown, Matthew W; Kamikawa, Ryoma.

Mol Biol Evol ; 39(4)2022 04 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35348760

6.

Phylogenetic placement of the protosteloid amoeba Microglomus paxillus identifies another case of sporocarpic fruiting in Discosea (Amoebozoa).

Tice, Alexander K; Spiegel, Frederick W; Brown, Matthew W.

J Eukaryot Microbiol ; 70(4): e12971, 2023.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36825799

7.

Novel Doublesex Duplication Associated with Sexually Dimorphic Development of Dogface Butterfly Wings.

Rodriguez-Caro, Fernando; Fenner, Jennifer; Bhardwaj, Shivam; Cole, Jared; Benson, Caleb; Colombara, Alexandra M; Papa, Riccardo; Brown, Matthew W; Martin, Arnaud; Range, Ryan C; Counterman, Brian A.

Mol Biol Evol ; 38(11): 5021-5033, 2021 10 27.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34323995

8.

Environmental Breviatea harbour mutualistic Arcobacter epibionts.

Hamann, Emmo; Gruber-Vodicka, Harald; Kleiner, Manuel; Tegetmeyer, Halina E; Riedel, Dietmar; Littmann, Sten; Chen, Jianwei; Milucka, Jana; Viehweger, Bernhard; Becker, Kevin W; Dong, Xiaoli; Stairs, Courtney W; Hinrichs, Kai-Uwe; Brown, Matthew W; Roger, Andrew J; Strous, Marc.

Nature ; 534(7606): 254-8, 2016 06 09.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27279223

9.

Ancient Adaptive Lateral Gene Transfers in the Symbiotic Opalina-Blastocystis Stramenopile Lineage.

Yubuki, Naoji; Galindo, Luis Javier; Reboul, Guillaume; López-García, Purificación; Brown, Matthew W; Pollet, Nicolas; Moreira, David.

Mol Biol Evol ; 37(3): 651-659, 2020 03 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31693153

10.

EukRef: Phylogenetic curation of ribosomal RNA to enhance understanding of eukaryotic diversity and distribution.

Del Campo, Javier; Kolisko, Martin; Boscaro, Vittorio; Santoferrara, Luciana F; Nenarokov, Serafim; Massana, Ramon; Guillou, Laure; Simpson, Alastair; Berney, Cedric; de Vargas, Colomban; Brown, Matthew W; Keeling, Patrick J; Wegener Parfrey, Laura.

PLoS Biol ; 16(9): e2005849, 2018 09.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30222734

11.

An efficient single-cell transcriptomics workflow for microbial eukaryotes benchmarked on Giardia intestinalis cells.

Onsbring, Henning; Tice, Alexander K; Barton, Brandon T; Brown, Matthew W; Ettema, Thijs J G.

BMC Genomics ; 21(1): 448, 2020 Jun 29.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32600266

12.

Integrated analysis of multiple receptor tyrosine kinases identifies Axl as a therapeutic target and mediator of resistance to sorafenib in hepatocellular carcinoma.

Pinato, David J; Brown, Matthew W; Trousil, Sebastian; Aboagye, Eric O; Beaumont, Jamie; Zhang, Hua; Coley, Helen M; Mauri, Francesco A; Sharma, Rohini.

Br J Cancer ; 120(5): 512-521, 2019 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30765873

13.

Description of Armaparvus languidus n. gen. n. sp. Confirms Ultrastructural Unity of Cutosea (Amoebozoa, Evosea).

Schuler, Gabriel A; Brown, Matthew W.

J Eukaryot Microbiol ; 66(1): 158-166, 2019 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29858563

14.

A Non-Flagellated Member of the Myxogastria and Expansion of the Echinosteliida.

Fiore-Donno, Anna Maria; Tice, Alexander K; Brown, Matthew W.

J Eukaryot Microbiol ; 66(4): 538-544, 2019 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30329204

15.

Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes.

Adl, Sina M; Bass, David; Lane, Christopher E; Lukes, Julius; Schoch, Conrad L; Smirnov, Alexey; Agatha, Sabine; Berney, Cedric; Brown, Matthew W; Burki, Fabien; Cárdenas, Paco; Cepicka, Ivan; Chistyakova, Lyudmila; Del Campo, Javier; Dunthorn, Micah; Edvardsen, Bente; Eglit, Yana; Guillou, Laure; Hampl, Vladimír; Heiss, Aaron A; Hoppenrath, Mona; James, Timothy Y; Karnkowska, Anna; Karpov, Sergey; Kim, Eunsoo; Kolisko, Martin; Kudryavtsev, Alexander; Lahr, Daniel J G; Lara, Enrique; Le Gall, Line; Lynn, Denis H; Mann, David G; Massana, Ramon; Mitchell, Edward A D; Morrow, Christine; Park, Jong Soo; Pawlowski, Jan W; Powell, Martha J; Richter, Daniel J; Rueckert, Sonja; Shadwick, Lora; Shimano, Satoshi; Spiegel, Frederick W; Torruella, Guifré; Youssef, Noha; Zlatogursky, Vasily; Zhang, Qianqian.

J Eukaryot Microbiol ; 66(1): 4-119, 2019 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30257078

16.

Between a Pod and a Hard Test: The Deep Evolution of Amoebae.

Kang, Seungho; Tice, Alexander K; Spiegel, Frederick W; Silberman, Jeffrey D; Pánek, Tomás; Cepicka, Ivan; Kostka, Martin; Kosakyan, Anush; Alcântara, Daniel M C; Roger, Andrew J; Shadwick, Lora L; Smirnov, Alexey; Kudryavtsev, Alexander; Lahr, Daniel J G; Brown, Matthew W.

Mol Biol Evol ; 34(9): 2258-2270, 2017 09 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28505375

17.

A genetic toolbox for marine protists.

Brown, Matthew W; Tice, Alexander K.

Nat Methods ; 17(5): 469-470, 2020 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32251395

18.

Coprophilic amoebae and flagellates, including Guttulinopsis, Rosculus and Helkesimastix, characterise a divergent and diverse rhizarian radiation and contribute to a large diversity of faecal-associated protists.

Bass, David; Silberman, Jeffrey D; Brown, Matthew W; Pearce, Rebecca A; Tice, Alexander K; Jousset, Alexandre; Geisen, Stefan; Hartikainen, Hanna.

Environ Microbiol ; 18(5): 1604-19, 2016 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26914587

19.

Evolution of bacterial recombinase A (recA) in eukaryotes explained by addition of genomic data of key microbial lineages.

Hofstatter, Paulo G; Tice, Alexander K; Kang, Seungho; Brown, Matthew W; Lahr, Daniel J G.

Proc Biol Sci ; 283(1840)2016 10 12.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27708147

20.

Complex evolution of two types of cardiolipin synthase in the eukaryotic lineage stramenopiles.

Noguchi, Fumiya; Tanifuji, Goro; Brown, Matthew W; Fujikura, Katsunori; Takishita, Kiyotaka.

Mol Phylogenet Evol ; 101: 133-141, 2016 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27173914

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