Búsqueda | Portal de Búsqueda de la BVS Ecuador

1.

Identifying cis Elements for Spatiotemporal Control of Mammalian DNA Replication.

Sima, Jiao; Chakraborty, Abhijit; Dileep, Vishnu; Michalski, Marco; Klein, Kyle N; Holcomb, Nicolas P; Turner, Jesse L; Paulsen, Michelle T; Rivera-Mulia, Juan Carlos; Trevilla-Garcia, Claudia; Bartlett, Daniel A; Zhao, Peiyao A; Washburn, Brian K; Nora, Elphège P; Kraft, Katerina; Mundlos, Stefan; Bruneau, Benoit G; Ljungman, Mats; Fraser, Peter; Ay, Ferhat; Gilbert, David M.

Cell ; 176(4): 816-830.e18, 2019 02 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30595451

2.

Lineage-Specific Genome Architecture Links Enhancers and Non-coding Disease Variants to Target Gene Promoters.

Javierre, Biola M; Burren, Oliver S; Wilder, Steven P; Kreuzhuber, Roman; Hill, Steven M; Sewitz, Sven; Cairns, Jonathan; Wingett, Steven W; Várnai, Csilla; Thiecke, Michiel J; Burden, Frances; Farrow, Samantha; Cutler, Antony J; Rehnström, Karola; Downes, Kate; Grassi, Luigi; Kostadima, Myrto; Freire-Pritchett, Paula; Wang, Fan; Stunnenberg, Hendrik G; Todd, John A; Zerbino, Daniel R; Stegle, Oliver; Ouwehand, Willem H; Frontini, Mattia; Wallace, Chris; Spivakov, Mikhail; Fraser, Peter.

Cell ; 167(5): 1369-1384.e19, 2016 11 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27863249

3.

The genetic regulatory architecture and epigenomic basis for age-related changes in rattlesnake venom.

Hogan, Michael P; Holding, Matthew L; Nystrom, Gunnar S; Colston, Timothy J; Bartlett, Daniel A; Mason, Andrew J; Ellsworth, Schyler A; Rautsaw, Rhett M; Lawrence, Kylie C; Strickland, Jason L; He, Bing; Fraser, Peter; Margres, Mark J; Gilbert, David M; Gibbs, H Lisle; Parkinson, Christopher L; Rokyta, Darin R.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 121(16): e2313440121, 2024 Apr 16.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38578985

4.

No-nonsense functions for long noncoding RNAs.

Nagano, Takashi; Fraser, Peter.

Cell ; 145(2): 178-81, 2011 Apr 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21496640

5.

Parental-to-embryo switch of chromosome organization in early embryogenesis.

Collombet, Samuel; Ranisavljevic, Noémie; Nagano, Takashi; Varnai, Csilla; Shisode, Tarak; Leung, Wing; Piolot, Tristan; Galupa, Rafael; Borensztein, Maud; Servant, Nicolas; Fraser, Peter; Ancelin, Katia; Heard, Edith.

Nature ; 580(7801): 142-146, 2020 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32238933

6.

Rationally designed chimeric PI3K-BET bromodomain inhibitors elicit curative responses in MYC-driven lymphoma.

Oh, Danielle H; Ma, Xiao; Hogg, Simon J; He, Jackson; Kearney, Conor; Brasacchio, Daniella; Susanto, Olivia; Maher, Belinda; Jennings, Ian G; Newbold, Andrea; Fraser, Peter; Gruber, Emily; Kats, Lev M; Gregory, Gareth P; Johnstone, Ricky W; Thompson, Philip E; Shortt, Jake.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(36): e2306414120, 2023 09 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37643213

7.

Long-range enhancer-promoter contacts in gene expression control.

Schoenfelder, Stefan; Fraser, Peter.

Nat Rev Genet ; 20(8): 437-455, 2019 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31086298

8.

Dynamic Rewiring of Promoter-Anchored Chromatin Loops during Adipocyte Differentiation.

Siersbæk, Rasmus; Madsen, Jesper Grud Skat; Javierre, Biola Maria; Nielsen, Ronni; Bagge, Emilie Kristine; Cairns, Jonathan; Wingett, Steven William; Traynor, Sofie; Spivakov, Mikhail; Fraser, Peter; Mandrup, Susanne.

Mol Cell ; 66(3): 420-435.e5, 2017 May 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28475875

9.

Chromosome organization through the cell cycle at a glance.

Srinivasan, Divyaa; Shisode, Tarak; Shrinet, Jatin; Fraser, Peter.

J Cell Sci ; 135(10)2022 05 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35608019

10.

Cellular reprogramming is driven by widespread rewiring of promoter-enhancer interactions.

Wang, Miao; He, Bing; Hao, Yueling; Srinivasan, Divyaa; Shrinet, Jatin; Fraser, Peter.

BMC Biol ; 21(1): 264, 2023 11 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37981682

11.

Short- and long-range cis interactions between integrated HPV genomes and cellular chromatin dysregulate host gene expression in early cervical carcinogenesis.

Groves, Ian J; Drane, Emma L A; Michalski, Marco; Monahan, Jack M; Scarpini, Cinzia G; Smith, Stephen P; Bussotti, Giovanni; Várnai, Csilla; Schoenfelder, Stefan; Fraser, Peter; Enright, Anton J; Coleman, Nicholas.

PLoS Pathog ; 17(8): e1009875, 2021 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34432858

12.

Turning the tide on 3D nuclear organization.

Fraser, Peter.

Nat Rev Mol Cell Biol ; 17(12): 738, 2016 12.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27808275

13.

Interchromosomal huddle kickstarts antiviral defense.

Schoenfelder, Stefan; Fraser, Peter.

Cell ; 134(1): 14-6, 2008 Jul 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18614003

14.

Cell-cycle dynamics of chromosomal organization at single-cell resolution.

Nagano, Takashi; Lubling, Yaniv; Várnai, Csilla; Dudley, Carmel; Leung, Wing; Baran, Yael; Mendelson Cohen, Netta; Wingett, Steven; Fraser, Peter; Tanay, Amos.

Nature ; 547(7661): 61-67, 2017 07 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28682332

15.

Active and repressed biosynthetic gene clusters have spatially distinct chromosome states.

Nützmann, Hans-Wilhelm; Doerr, Daniel; Ramírez-Colmenero, América; Sotelo-Fonseca, Jesús Emiliano; Wegel, Eva; Di Stefano, Marco; Wingett, Steven W; Fraser, Peter; Hurst, Laurence; Fernandez-Valverde, Selene L; Osbourn, Anne.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 117(24): 13800-13809, 2020 06 16.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32493747

16.

Topologically associating domains and chromatin loops depend on cohesin and are regulated by CTCF, WAPL, and PDS5 proteins.

Wutz, Gordana; Várnai, Csilla; Nagasaka, Kota; Cisneros, David A; Stocsits, Roman R; Tang, Wen; Schoenfelder, Stefan; Jessberger, Gregor; Muhar, Matthias; Hossain, M Julius; Walther, Nike; Koch, Birgit; Kueblbeck, Moritz; Ellenberg, Jan; Zuber, Johannes; Fraser, Peter; Peters, Jan-Michael.

EMBO J ; 36(24): 3573-3599, 2017 12 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29217591

17.

Thrombopoietin signaling to chromatin elicits rapid and pervasive epigenome remodeling within poised chromatin architectures.

Comoglio, Federico; Park, Hyun Jung; Schoenfelder, Stefan; Barozzi, Iros; Bode, Daniel; Fraser, Peter; Green, Anthony R.

Genome Res ; 2018 02 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29429976

18.

Allele-specific control of replication timing and genome organization during development.

Rivera-Mulia, Juan Carlos; Dimond, Andrew; Vera, Daniel; Trevilla-Garcia, Claudia; Sasaki, Takayo; Zimmerman, Jared; Dupont, Catherine; Gribnau, Joost; Fraser, Peter; Gilbert, David M.

Genome Res ; 28(6): 800-811, 2018 06.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29735606

19.

High-resolution three-dimensional chromatin profiling of the Chinese hamster ovary cell genome.

Bevan, Stephen; Schoenfelder, Stefan; Young, Robert J; Zhang, Lin; Andrews, Simon; Fraser, Peter; O'Callaghan, Peter M.

Biotechnol Bioeng ; 118(2): 784-796, 2021 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33095445

20.

Single-cell Hi-C reveals cell-to-cell variability in chromosome structure.

Nagano, Takashi; Lubling, Yaniv; Stevens, Tim J; Schoenfelder, Stefan; Yaffe, Eitan; Dean, Wendy; Laue, Ernest D; Tanay, Amos; Fraser, Peter.

Nature ; 502(7469): 59-64, 2013 Oct 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24067610

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