Búsqueda | Portal de Búsqueda de la BVS Ecuador

1.

SnapShot: Intrinsic Structural Disorder.

Guharoy, Mainak; Pauwels, Kris; Tompa, Peter.

Cell ; 161(5): 1230-1230.e1, 2015 May 21.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26000490

2.

Phase Separation of C9orf72 Dipeptide Repeats Perturbs Stress Granule Dynamics.

Boeynaems, Steven; Bogaert, Elke; Kovacs, Denes; Konijnenberg, Albert; Timmerman, Evy; Volkov, Alex; Guharoy, Mainak; De Decker, Mathias; Jaspers, Tom; Ryan, Veronica H; Janke, Abigail M; Baatsen, Pieter; Vercruysse, Thomas; Kolaitis, Regina-Maria; Daelemans, Dirk; Taylor, J Paul; Kedersha, Nancy; Anderson, Paul; Impens, Francis; Sobott, Frank; Schymkowitz, Joost; Rousseau, Frederic; Fawzi, Nicolas L; Robberecht, Wim; Van Damme, Philip; Tompa, Peter; Van Den Bosch, Ludo.

Mol Cell ; 65(6): 1044-1055.e5, 2017 Mar 16.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28306503

3.

SNPeffect 5.0: large-scale structural phenotyping of protein coding variants extracted from next-generation sequencing data using AlphaFold models.

Janssen, Kobe; Duran-Romaña, Ramon; Bottu, Guy; Guharoy, Mainak; Botzki, Alexander; Rousseau, Frederic; Schymkowitz, Joost.

BMC Bioinformatics ; 24(1): 287, 2023 Jul 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37464277

4.

DisProt: intrinsic protein disorder annotation in 2020.

Hatos, András; Hajdu-Soltész, Borbála; Monzon, Alexander M; Palopoli, Nicolas; Álvarez, Lucía; Aykac-Fas, Burcu; Bassot, Claudio; Benítez, Guillermo I; Bevilacqua, Martina; Chasapi, Anastasia; Chemes, Lucia; Davey, Norman E; Davidovic, Radoslav; Dunker, A Keith; Elofsson, Arne; Gobeill, Julien; Foutel, Nicolás S González; Sudha, Govindarajan; Guharoy, Mainak; Horvath, Tamas; Iglesias, Valentin; Kajava, Andrey V; Kovacs, Orsolya P; Lamb, John; Lambrughi, Matteo; Lazar, Tamas; Leclercq, Jeremy Y; Leonardi, Emanuela; Macedo-Ribeiro, Sandra; Macossay-Castillo, Mauricio; Maiani, Emiliano; Manso, José A; Marino-Buslje, Cristina; Martínez-Pérez, Elizabeth; Mészáros, Bálint; Micetic, Ivan; Minervini, Giovanni; Murvai, Nikoletta; Necci, Marco; Ouzounis, Christos A; Pajkos, Mátyás; Paladin, Lisanna; Pancsa, Rita; Papaleo, Elena; Parisi, Gustavo; Pasche, Emilie; Barbosa Pereira, Pedro J; Promponas, Vasilis J; Pujols, Jordi; Quaglia, Federica.

Nucleic Acids Res ; 48(D1): D269-D276, 2020 01 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31713636

5.

Distance-Based Metrics for Comparing Conformational Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins.

Lazar, Tamas; Guharoy, Mainak; Vranken, Wim; Rauscher, Sarah; Wodak, Shoshana J; Tompa, Peter.

Biophys J ; 118(12): 2952-2965, 2020 06 16.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32502383

6.

Numerous proteins with unique characteristics are degraded by the 26S proteasome following monoubiquitination.

Braten, Ori; Livneh, Ido; Ziv, Tamar; Admon, Arie; Kehat, Izhak; Caspi, Lilac H; Gonen, Hedva; Bercovich, Beatrice; Godzik, Adam; Jahandideh, Samad; Jaroszewski, Lukasz; Sommer, Thomas; Kwon, Yong Tae; Guharoy, Mainak; Tompa, Peter; Ciechanover, Aaron.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 113(32): E4639-47, 2016 08 09.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27385826

7.

Disordered Substrates of the 20S Proteasome Link Degradation with Phase Separation.

Guharoy, Mainak; Lazar, Tamas; Tompa, Peter.

Proteomics ; 18(21-22): e1800276, 2018 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30070766

8.

Unique Physicochemical Patterns of Residues in Protein-Protein Interfaces.

Lazar, Tamas; Guharoy, Mainak; Schad, Eva; Tompa, Peter.

J Chem Inf Model ; 58(10): 2164-2173, 2018 10 22.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30212197

9.

Design Principles Involving Protein Disorder Facilitate Specific Substrate Selection and Degradation by the Ubiquitin-Proteasome System.

Guharoy, Mainak; Bhowmick, Pallab; Tompa, Peter.

J Biol Chem ; 291(13): 6723-31, 2016 Mar 25.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26851277

10.

DisCons: a novel tool to quantify and classify evolutionary conservation of intrinsic protein disorder.

Varadi, Mihaly; Guharoy, Mainak; Zsolyomi, Fruzsina; Tompa, Peter.

BMC Bioinformatics ; 16: 153, 2015 May 13.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25968230

11.

Ensemble Methods Enable a New Definition for the Solution to Gas-Phase Transfer of Intrinsically Disordered Proteins.

Borysik, Antoni J; Kovacs, Denes; Guharoy, Mainak; Tompa, Peter.

J Am Chem Soc ; 137(43): 13807-17, 2015 Nov 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26437245

12.

Bioinformatics Approaches for Predicting Disordered Protein Motifs.

Bhowmick, Pallab; Guharoy, Mainak; Tompa, Peter.

Adv Exp Med Biol ; 870: 291-318, 2015.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26387106

13.

Characterization and prediction of the binding site in DNA-binding proteins: improvement of accuracy by combining residue composition, evolutionary conservation and structural parameters.

Dey, Sucharita; Pal, Arumay; Guharoy, Mainak; Sonavane, Shrihari; Chakrabarti, Pinak.

Nucleic Acids Res ; 40(15): 7150-61, 2012 Aug.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22641851

14.

Degron masking outlines degronons, co-degrading functional modules in the proteome.

Guharoy, Mainak; Lazar, Tamas; Macossay-Castillo, Mauricio; Tompa, Peter.

Commun Biol ; 5(1): 445, 2022 05 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35545699

15.

PRICE (PRotein Interface Conservation and Energetics): a server for the analysis of protein-protein interfaces.

Guharoy, Mainak; Pal, Arumay; Dasgupta, Maitrayee; Chakrabarti, Pinak.

J Struct Funct Genomics ; 12(1): 33-41, 2011 Mar.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21519818

16.

Conserved residue clusters at protein-protein interfaces and their use in binding site identification.

Guharoy, Mainak; Chakrabarti, Pinak.

BMC Bioinformatics ; 11: 286, 2010 May 27.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20507585

17.

Side-chain rotamer transitions at protein-protein interfaces.

Guharoy, Mainak; Janin, Joël; Robert, Charles H.

Proteins ; 78(15): 3219-25, 2010 Nov 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20737439

18.

Dissection, residue conservation, and structural classification of protein-DNA interfaces.

Biswas, Sumit; Guharoy, Mainak; Chakrabarti, Pinak.

Proteins ; 74(3): 643-54, 2009 Feb 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18704949

19.

Empirical estimation of the energetic contribution of individual interface residues in structures of protein-protein complexes.

Guharoy, Mainak; Chakrabarti, Pinak.

J Comput Aided Mol Des ; 23(9): 645-54, 2009 Sep.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19479323

20.

The Balancing Act of Intrinsically Disordered Proteins: Enabling Functional Diversity while Minimizing Promiscuity.

Macossay-Castillo, Mauricio; Marvelli, Giulio; Guharoy, Mainak; Jain, Aashish; Kihara, Daisuke; Tompa, Peter; Wodak, Shoshana J.

J Mol Biol ; 431(8): 1650-1670, 2019 04 05.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30878482

Portal de Búsqueda de la BVS Ecuador

Información y Conocimiento para la Salud

Configurar filtros

Su selección (0)

Formato de exportación:

Exportar: