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1.

Identification of HIF-dependent alternative splicing in gastrointestinal cancers and characterization of a long, coding isoform of SLC35A3.

Markolin, Philipp; Davidson, Natalie; Hirt, Christian K; Chabbert, Christophe D; Zamboni, Nicola; Schwank, Gerald; Krek, Wilhelm; Rätsch, Gunnar.

Genomics ; 113(2): 515-529, 2021 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-33418078

2.

HIF-driven SF3B1 induces KHK-C to enforce fructolysis and heart disease.

Mirtschink, Peter; Krishnan, Jaya; Grimm, Fiona; Sarre, Alexandre; Hörl, Manuel; Kayikci, Melis; Fankhauser, Niklaus; Christinat, Yann; Cortijo, Cédric; Feehan, Owen; Vukolic, Ana; Sossalla, Samuel; Stehr, Sebastian N; Ule, Jernej; Zamboni, Nicola; Pedrazzini, Thierry; Krek, Wilhelm.

Nature ; 522(7557): 444-449, 2015 Jun 25.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26083752

3.

Inhibition of the Hypoxia-Inducible Factor 1α-Induced Cardiospecific HERNA1 Enhance-Templated RNA Protects From Heart Disease.

Mirtschink, Peter; Bischof, Corinne; Pham, Minh-Duc; Sharma, Rahul; Khadayate, Sanjay; Rossi, Geetha; Fankhauser, Niklaus; Traub, Shuyang; Sossalla, Samuel; Hagag, Eman; Berthonneche, Corinne; Sarre, Alexandre; Stehr, Sebastian N; Grote, Phillip; Pedrazzini, Thierry; Dimmeler, Stefanie; Krek, Wilhelm; Krishnan, Jaya.

Circulation ; 139(24): 2778-2792, 2019 06 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30922078

4.

Dietary obesity-associated Hif1α activation in adipocytes restricts fatty acid oxidation and energy expenditure via suppression of the Sirt2-NAD+ system.

Krishnan, Jaya; Danzer, Carsten; Simka, Tatiana; Ukropec, Josef; Walter, Katharina Manuela; Kumpf, Susann; Mirtschink, Peter; Ukropcova, Barbara; Gasperikova, Daniela; Pedrazzini, Thierry; Krek, Wilhelm.

Genes Dev ; 26(3): 259-70, 2012 Feb 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22302938

5.

NGS-pipe: a flexible, easily extendable and highly configurable framework for NGS analysis.

Singer, Jochen; Ruscheweyh, Hans-Joachim; Hofmann, Ariane L; Thurnherr, Thomas; Singer, Franziska; Toussaint, Nora C; Ng, Charlotte K Y; Piscuoglio, Salvatore; Beisel, Christian; Christofori, Gerhard; Dummer, Reinhard; Hall, Michael N; Krek, Wilhelm; Levesque, Mitchell P; Manz, Markus G; Moch, Holger; Papassotiropoulos, Andreas; Stekhoven, Daniel J; Wild, Peter; Wüst, Thomas; Rinn, Bernd; Beerenwinkel, Niko.

Bioinformatics ; 34(1): 107-108, 2018 01 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28968639

6.

Fructose metabolism, cardiometabolic risk, and the epidemic of coronary artery disease.

Mirtschink, Peter; Jang, Cholsoon; Arany, Zoltan; Krek, Wilhelm.

Eur Heart J ; 39(26): 2497-2505, 2018 07 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29020416

7.

Hypoxia-driven glycolytic and fructolytic metabolic programs: Pivotal to hypertrophic heart disease.

Mirtschink, Peter; Krek, Wilhelm.

Biochim Biophys Acta ; 1863(7 Pt B): 1822-8, 2016 Jul.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26896647

8.

jSplice: a high-performance method for accurate prediction of alternative splicing events and its application to large-scale renal cancer transcriptome data.

Christinat, Yann; Pawlowski, Rafal; Krek, Wilhelm.

Bioinformatics ; 32(14): 2111-9, 2016 07 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27153587

9.

HIF1α deubiquitination by USP8 is essential for ciliogenesis in normoxia.

Troilo, Albino; Alexander, Irina; Muehl, Sarah; Jaramillo, Daniela; Knobeloch, Klaus-Peter; Krek, Wilhelm.

EMBO Rep ; 15(1): 77-85, 2014 Jan.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24378640

10.

KPNA2 is overexpressed in human and mouse endometrial cancers and promotes cellular proliferation.

Ikenberg, Kristian; Valtcheva, Nadejda; Brandt, Simone; Zhong, Qing; Wong, Christine E; Noske, Aurelia; Rechsteiner, Markus; Rueschoff, Jan H; Caduff, Rosmarie; Dellas, Athanassios; Obermann, Ellen; Fink, Daniel; Fuchs, Thomas; Krek, Wilhelm; Moch, Holger; Frew, Ian J; Wild, Peter J.

J Pathol ; 234(2): 239-52, 2014 Oct.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24930886

11.

PKA phosphorylates and inactivates AMPKalpha to promote efficient lipolysis.

Djouder, Nabil; Tuerk, Roland D; Suter, Marianne; Salvioni, Paolo; Thali, Ramon F; Scholz, Roland; Vaahtomeri, Kari; Auchli, Yolanda; Rechsteiner, Helene; Brunisholz, René A; Viollet, Benoit; Mäkelä, Tomi P; Wallimann, Theo; Neumann, Dietbert; Krek, Wilhelm.

EMBO J ; 29(2): 469-81, 2010 Jan 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19942859

12.

Multitasking by pVHL in tumour suppression.

Frew, Ian J; Krek, Wilhelm.

Curr Opin Cell Biol ; 19(6): 685-90, 2007 Dec.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18006292

13.

pVHL and GSK3beta are components of a primary cilium-maintenance signalling network.

Thoma, Claudio R; Frew, Ian J; Hoerner, Christian R; Montani, Matteo; Moch, Holger; Krek, Wilhelm.

Nat Cell Biol ; 9(5): 588-95, 2007 May.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-17450132

14.

The protein tyrosine phosphatase receptor type J is regulated by the pVHL-HIF axis in clear cell renal cell carcinoma.

Casagrande, Silvia; Ruf, Melanie; Rechsteiner, Markus; Morra, Laura; Brun-Schmid, Sonja; von Teichman, Adriana; Krek, Wilhelm; Schraml, Peter; Moch, Holger.

J Pathol ; 229(4): 525-34, 2013 Mar.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23007793

15.

Cancer genetics-guided discovery of serum biomarker signatures for diagnosis and prognosis of prostate cancer.

Cima, Igor; Schiess, Ralph; Wild, Peter; Kaelin, Martin; Schüffler, Peter; Lange, Vinzenz; Picotti, Paola; Ossola, Reto; Templeton, Arnoud; Schubert, Olga; Fuchs, Thomas; Leippold, Thomas; Wyler, Stephen; Zehetner, Jens; Jochum, Wolfram; Buhmann, Joachim; Cerny, Thomas; Moch, Holger; Gillessen, Silke; Aebersold, Ruedi; Krek, Wilhelm.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 108(8): 3342-7, 2011 Feb 22.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21300890

16.

Loss of PBRM1 expression is associated with renal cell carcinoma progression.

Pawlowski, Rafal; Mühl, Sarah M; Sulser, Tullio; Krek, Wilhelm; Moch, Holger; Schraml, Peter.

Int J Cancer ; 132(2): E11-7, 2013 Jan 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22949125

17.

Analysis of microtubule dynamic instability using a plus-end growth marker.

Matov, Alexandre; Applegate, Kathryn; Kumar, Praveen; Thoma, Claudio; Krek, Wilhelm; Danuser, Gaudenz; Wittmann, Torsten.

Nat Methods ; 7(9): 761-8, 2010 Sep.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-20729842

18.

Comprehensive description of the N-glycoproteome of mouse pancreatic ß-cells and human islets.

Danzer, Carsten; Eckhardt, Katrin; Schmidt, Alexander; Fankhauser, Niklaus; Ribrioux, Sebastien; Wollscheid, Bernd; Müller, Lukas; Schiess, Ralph; Züllig, Richard; Lehmann, Roger; Spinas, Giatgen; Aebersold, Rudolf; Krek, Wilhelm.

J Proteome Res ; 11(3): 1598-608, 2012 Mar 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22148984

19.

pVHL and PTEN tumour suppressor proteins cooperatively suppress kidney cyst formation.

Frew, Ian J; Thoma, Claudio R; Georgiev, Strahil; Minola, Andrea; Hitz, Manuela; Montani, Matteo; Moch, Holger; Krek, Wilhelm.

EMBO J ; 27(12): 1747-57, 2008 Jun 18.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18497742

20.

Longitudinal evaluation of intramyocellular lipids (IMCLs) in tibialis anterior muscle of ob/ob and ob/+ control mice using a cryogenic surface coil at 9.4 T.

Ye, Qiong; Danzer, Carsten Friedrich; Fuchs, Alexander; Krek, Wilhelm; Mueggler, Thomas; Baltes, Christof; Rudin, Markus.

NMR Biomed ; 24(10): 1295-301, 2011 Dec.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-22223365

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