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1.

NeuronMotif: Deciphering cis-regulatory codes by layer-wise demixing of deep neural networks.

Wei, Zheng; Hua, Kui; Wei, Lei; Ma, Shining; Jiang, Rui; Zhang, Xuegong; Li, Yanda; Wong, Wing H; Wang, Xiaowo.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(15): e2216698120, 2023 04 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37023129

2.

Mutations in human DNA methyltransferase DNMT1 induce specific genome-wide epigenomic and transcriptomic changes in neurodevelopment.

Davis, Kasey N; Qu, Ping-Ping; Ma, Shining; Lin, Ling; Plastini, Melanie; Dahl, Niklas; Plazzi, Giuseppe; Pizza, Fabio; O'Hara, Ruth; Wong, Wing Hung; Hallmayer, Joachim; Mignot, Emmanuel; Zhang, Xianglong; Urban, Alexander E.

Hum Mol Genet ; 32(21): 3105-3120, 2023 10 17.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37584462

3.

Leveraging cell-type-specific regulatory networks to interpret genetic variants in abdominal aortic aneurysm.

Ma, Shining; Chen, Xi; Zhu, Xiang; Tsao, Philip S; Wong, Wing Hung.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 119(1)2022 01 04.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-34930827

4.

Design of an image-based BRDF measurement method using a catadioptric multispectral capture and a real-time Lambert calibration.

Yuan, Yue; Sun, Ruoduan; Xu, Chen; Ma, Shining; Liu, Yue; Wang, Yongtian; Song, Weitao.

Opt Express ; 32(1): 425-443, 2024 Jan 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38175073

5.

Adaptation under dichromatic illumination.

Ma, Shining; Teunissen, Kees; Smet, Kevin A G.

Opt Express ; 31(24): 40411-40434, 2023 Nov 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38041343

6.

Effect of surrounding objects in the adapting scene on chromatic adaptation.

Ma, Shining; Sun, Ruoduan; Liu, Yue; Wang, Yongtian; Song, Weitao.

Opt Express ; 31(11): 18587-18598, 2023 May 22.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-37381568

7.

Integrated functional genomic analyses of Klinefelter and Turner syndromes reveal global network effects of altered X chromosome dosage.

Zhang, Xianglong; Hong, David; Ma, Shining; Ward, Thomas; Ho, Marcus; Pattni, Reenal; Duren, Zhana; Stankov, Atanas; Bade Shrestha, Sharon; Hallmayer, Joachim; Wong, Wing Hung; Reiss, Allan L; Urban, Alexander E.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 117(9): 4864-4873, 2020 03 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32071206

8.

Predictive performance of the standard and the modified von Kries chromatic adaptation transforms.

Ma, Shining; Teunissen, Kees; Smet, Kevin A G.

Opt Express ; 30(7): 11872-11891, 2022 Mar 28.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-35473122

9.

Design, analysis and optimization of a waveguide-type near-eye display using a pin-mirror array and a concaved reflector.

Zhang, Qingtian; Piao, Yongri; Ma, Shining; Liu, Yue; Wang, Yongtian; Song, Weitao.

Opt Express ; 30(18): 33208-33221, 2022 Aug 29.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36242366

10.

Transition type influences the adaptation state under dichromatic illuminations.

Ma, Shining; Li, Siqi; Sun, Ruoduan; Liu, Yue; Wang, Yongtian; Song, Weitao.

Opt Express ; 30(26): 47134-47151, 2022 Dec 19.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36558650

11.

Design of a dual focal-plane near-eye display using diffractive waveguides and multiple lenses.

Shi, Xiaogang; Xue, Zhenghui; Ma, Shining; Wang, Bingjie; Liu, Yue; Wang, Yongtian; Song, Weitao.

Appl Opt ; 61(20): 5844-5849, 2022 Jul 10.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-36255821

12.

Effect of adapting field size on chromatic adaptation.

Ma, Shining; Hanselaer, Peter; Teunissen, Kees; Smet, Kevin A G.

Opt Express ; 28(12): 17266-17285, 2020 Jun 08.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32679938

13.

FreePSI: an alignment-free approach to estimating exon-inclusion ratios without a reference transcriptome.

Zhou, Jianyu; Ma, Shining; Wang, Dongfang; Zeng, Jianyang; Jiang, Tao.

Nucleic Acids Res ; 46(2): e11, 2018 01 25.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29136203

14.

Impact of the starting point chromaticity on memory color matching accuracy.

Ma, Shining; Hanselaer, Peter; Teunissen, Kees; Smet, Kevin A G.

Opt Express ; 27(24): 35308-35324, 2019 Nov 25.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-31878702

15.

Constructing tissue-specific transcriptional regulatory networks via a Markov random field.

Ma, Shining; Jiang, Tao; Jiang, Rui.

BMC Genomics ; 19(Suppl 10): 884, 2018 Dec 31.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30598101

16.

Evaluation of whiteness formulas for FWA and non-FWA whites.

Wei, Minchen; Ma, Shining; Wang, Yuzhao; Luo, Ming Ronnier.

J Opt Soc Am A Opt Image Sci Vis ; 34(4): 640-647, 2017 Apr 01.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-28375334

17.

Differential regulation enrichment analysis via the integration of transcriptional regulatory network and gene expression data.

Ma, Shining; Jiang, Tao; Jiang, Rui.

Bioinformatics ; 31(4): 563-71, 2015 Feb 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25322838

18.

Accurate inference of isoforms from multiple sample RNA-Seq data.

Tasnim, Masruba; Ma, Shining; Yang, Ei-Wen; Jiang, Tao; Li, Wei.

BMC Genomics ; 16 Suppl 2: S15, 2015.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-25708199

19.

Genetic effects of sequence-conserved enhancer-like elements on human complex traits.

Zhu, Xiang; Ma, Shining; Wong, Wing Hung.

Genome Biol ; 25(1): 1, 2024 Jan 02.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38167462

20.

AudioGest: Gesture-based Interaction for Virtual Reality using Audio Devices.

Liu, Tong; Xiao, Yi; Hu, Mingwei; Sha, Hao; Ma, Shining; Gao, Boyu; Guo, Shihui; Liu, Yue; Song, Weitao.

IEEE Trans Vis Comput Graph ; PP2024 May 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-38713570

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