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1.
RNA Biol ; 18(2): 237-247, 2021 02.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-32286153

RESUMEN

LARP1 is an oncogenic RNA-binding protein required for ribosome biogenesis and cancer cell survival. From published in vitro studies, there is disparity over which of two different LARP1 protein isoforms (termed the long LI-LARP1 and short SI-LARP1) is the canonical. Here, after conducting a series of biochemical and cellular assays, we conclude that LI-LARP1 (NM_033551.3 > NP_056130.2) is the dominantly expressed form. We observe that SI-LARP1 (NM_015315.5> NP_056130.2) is epigenetically repressed and that this repression is evolutionarily conserved in all but a small subclade of mammalian species. As with other LARP family members, there are multiple potential LARP1 mRNA isoforms that appear to be censored within the nucleus. The capacity of the cell to modulate splicing and expression of these apparently 'redundant' mRNAs hints at contextually specific mechanisms of LARP1 expression.


Asunto(s)
Autoantígenos/genética , Regulación Neoplásica de la Expresión Génica , Ribonucleoproteínas/genética , Empalme Alternativo , Secuencia de Aminoácidos , Autoantígenos/química , Autoantígenos/metabolismo , Línea Celular Tumoral , Metilación de ADN , Silenciador del Gen , Humanos , Familia de Multigenes , Especificidad de Órganos , Regiones Promotoras Genéticas , Unión Proteica , Isoformas de Proteínas/genética , Isoformas de Proteínas/metabolismo , ARN/genética , ARN/metabolismo , Proteínas de Unión al ARN/química , Proteínas de Unión al ARN/genética , Proteínas de Unión al ARN/metabolismo , Ribonucleoproteínas/química , Ribonucleoproteínas/metabolismo , Antígeno SS-B
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