Detalles de la búsqueda
1.
Polymorphism in F pocket affects peptide selection and stability of type 1 diabetes-associated HLA-B39 allotypes.
Eur J Immunol
; : e2350683, 2024 Mar 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38549458
2.
Epistatic Effects Between Amino Acid Insertions and Substitutions Mediate Toxin resistance of Vertebrate Na+,K+-ATPases.
Mol Biol Evol
; 39(12)2022 12 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36472530
3.
Unraveling the Allosteric Communication Mechanisms in T-Cell Receptor-Peptide-Loaded Major Histocompatibility Complex Dynamics Using Molecular Dynamics Simulations: An Approach Based on Dynamic Cross Correlation Maps and Residue Interaction Energy Calculations.
J Chem Inf Model
; 61(5): 2444-2453, 2021 05 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33930270
4.
ProSNEx: a web-based application for exploration and analysis of protein structures using network formalism.
Nucleic Acids Res
; 47(W1): W471-W476, 2019 07 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31114881
5.
Revisiting allostery in CREB-binding protein (CBP) using residue-based interaction energy.
J Comput Aided Mol Des
; 34(9): 965-974, 2020 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32430574
6.
Identification of novel inhibitors of the ABC transporter BmrA.
Bioorg Chem
; 105: 104452, 2020 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33212311
7.
gRINN: a tool for calculation of residue interaction energies and protein energy network analysis of molecular dynamics simulations.
Nucleic Acids Res
; 46(W1): W554-W562, 2018 07 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29800260
8.
DynaFace: Discrimination between Obligatory and Non-obligatory Protein-Protein Interactions Based on the Complex's Dynamics.
PLoS Comput Biol
; 11(10): e1004461, 2015 Oct.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26506003
9.
A computational docking study on the pH dependence of peptide binding to HLA-B27 sub-types differentially associated with ankylosing spondylitis.
J Comput Aided Mol Des
; 30(7): 569-81, 2016 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27506766
10.
Attenuation of Type IV pili activity by natural products.
J Biomol Struct Dyn
; : 1-11, 2024 Feb 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38305801
11.
Piperidine-based natural products targeting Type IV pili antivirulence: A computational approach.
J Mol Graph Model
; 119: 108382, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36463631
12.
DNABINDPROT: fluctuation-based predictor of DNA-binding residues within a network of interacting residues.
Nucleic Acids Res
; 38(Web Server issue): W417-23, 2010 Jul.
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| MEDLINE | ID: mdl-20478828
13.
Assessment of 13 in silico pathogenicity methods on cancer-related variants.
Comput Biol Med
; 145: 105434, 2022 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35364305
14.
Hydration modulates oxygen channel residues for oxygenation of cysteine dioxygenase: Perspectives from molecular dynamics simulations.
J Mol Graph Model
; 110: 108060, 2022 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34768230
15.
How Epstein-Barr virus envelope glycoprotein gp350 tricks the CR2? A molecular dynamics study.
J Mol Graph Model
; 114: 108196, 2022 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35500362
16.
In Silico Tools and Approaches for the Prediction of Functional and Structural Effects of Single-Nucleotide Polymorphisms on Proteins: An Expert Review.
OMICS
; 25(1): 23-37, 2021 01.
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| MEDLINE | ID: mdl-33058752
17.
Differential Interactome Based Drug Repositioning Unraveled Abacavir, Exemestane, Nortriptyline Hydrochloride, and Tolcapone as Potential Therapeutics for Colorectal Cancers.
Front Bioinform
; 1: 710591, 2021.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36303724
18.
Sequence-structure-function relationships in class I MHC: A local frustration perspective.
PLoS One
; 15(5): e0232849, 2020.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32421728
19.
Computational investigation of peptide binding stabilities of HLA-B*27 and HLA-B*44 alleles.
Comput Biol Chem
; 84: 107195, 2020 Feb.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31877499
20.
Next-Generation Sequencing Identifies BRCA1 and/or BRCA2 Mutations in Women at High Hereditary Risk for Breast Cancer with Shorter Telomere Length.
OMICS
; 24(1): 5-15, 2020 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31851867