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Mfd Dynamically Regulates Transcription via a Release and Catch-Up Mechanism.

Le, Tung T; Yang, Yi; Tan, Chuang; Suhanovsky, Margaret M; Fulbright, Robert M; Inman, James T; Li, Ming; Lee, Jaeyoon; Perelman, Sarah; Roberts, Jeffrey W; Deaconescu, Alexandra M; Wang, Michelle D.

Cell ; 172(1-2): 344-357.e15, 2018 01 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29224782

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5766421
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2017.11.017

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2.

Mfd Dynamically Regulates Transcription via a Release and Catch-Up Mechanism.

Le, Tung T; Yang, Yi; Tan, Chuang; Suhanovsky, Margaret M; Fulbright, Robert M; Inman, James T; Li, Ming; Lee, Jaeyoon; Perelman, Sarah; Roberts, Jeffrey W; Deaconescu, Alexandra M; Wang, Michelle D.

Cell ; 173(7): 1823, 2018 06 14.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-29906451

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6857632
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2018.06.002

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3.

Transcription factor regulation of RNA polymerase's torque generation capacity.

Ma, Jie; Tan, Chuang; Gao, Xiang; Fulbright, Robert M; Roberts, Jeffrey W; Wang, Michelle D.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 116(7): 2583-2588, 2019 02 12.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30635423

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6377492
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1807031116

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4.

A universal transcription pause sequence is an element of initiation factor σ70-dependent pausing.

Bird, Jeremy G; Strobel, Eric J; Roberts, Jeffrey W.

Nucleic Acids Res ; 44(14): 6732-40, 2016 08 19.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-27098041

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5001585
https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkw285

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5.

Two transcription pause elements underlie a σ70-dependent pause cycle.

Strobel, Eric J; Roberts, Jeffrey W.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 112(32): E4374-80, 2015 Aug 11.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-26216999

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4538648
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1512986112

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6.

Promoter-specific control of E. coli RNA polymerase by ppGpp and a general transcription factor.

Roberts, Jeffrey W.

Genes Dev ; 23(2): 143-6, 2009 Jan 15.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-19171778

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7.

Regulation of promoter-proximal transcription elongation: enhanced DNA scrunching drives λQ antiterminator-dependent escape from a σ70-dependent pause.

Strobel, Eric J; Roberts, Jeffrey W.

Nucleic Acids Res ; 42(8): 5097-108, 2014 Apr.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24550164

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4005639
https://dx.doi.org/10.1093/nar/gku147

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8.

High-resolution view of bacteriophage lambda gene expression by ribosome profiling.

Liu, Xiaoqiu; Jiang, Huifeng; Gu, Zhenglong; Roberts, Jeffrey W.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 110(29): 11928-33, 2013 Jul 16.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-23812753

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https://dx.doi.org/10.1073/pnas.1309739110

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9.

A backtrack-inducing sequence is an essential component of Escherichia coli σ(70)-dependent promoter-proximal pausing.

Perdue, Sarah A; Roberts, Jeffrey W.

Mol Microbiol ; 78(3): 636-50, 2010 Nov.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21382107

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3058920
https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2958.2010.07347.x

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10.

Mechanisms of Bacterial Transcription Termination.

Roberts, Jeffrey W.

J Mol Biol ; 431(20): 4030-4039, 2019 09 20.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30978344

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11.

Interactions among CII protein, RNA polymerase and the lambda PRE promoter: contacts between RNA polymerase and the -35 region of PRE are identical in the presence and absence of CII protein.

Marr, Michael T; Roberts, Jeffrey W; Brown, Susan E; Klee, Matthew; Gussin, Gary N.

Nucleic Acids Res ; 32(3): 1083-90, 2004.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-14872063

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12.

Role of the non-template strand of the elongation bubble in intrinsic transcription termination.

Ryder, Andrew M; Roberts, Jeffrey W.

J Mol Biol ; 334(2): 205-13, 2003 Nov 21.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-14607113

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13.

Σ(70)-dependent transcription pausing in Escherichia coli.

Perdue, Sarah A; Roberts, Jeffrey W.

J Mol Biol ; 412(5): 782-92, 2011 Oct 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-21316374

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14.

Formation of long DNA templates containing site-specific alkane-disulfide DNA interstrand cross-links for use in transcription reactions.

Santangelo, Thomas J; Roberts, Jeffrey W.

Methods Enzymol ; 371: 120-32, 2003.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-14712695

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15.

Molecular biology. Molecular basis of transcription pausing.

Roberts, Jeffrey W.

Science ; 344(6189): 1226-7, 2014 Jun 13.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-24926002

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16.

RNA polymerase elongation factors.

Roberts, Jeffrey W; Shankar, Smita; Filter, Joshua J.

Annu Rev Microbiol ; 62: 211-33, 2008.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-18729732

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2819089
https://dx.doi.org/10.1146/annurev.micro.61.080706.093422

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17.

A transcription antiterminator constructs a NusA-dependent shield to the emerging transcript.

Shankar, Smita; Hatoum, Asma; Roberts, Jeffrey W.

Mol Cell ; 27(6): 914-27, 2007 Sep 21.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-17889665

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18.

Role of DNA bubble rewinding in enzymatic transcription termination.

Park, Joo-Seop; Roberts, Jeffrey W.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 103(13): 4870-5, 2006 Mar 28.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16551743

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19.

Kinetic investigation of Escherichia coli RNA polymerase mutants that influence nucleotide discrimination and transcription fidelity.

Holmes, Shannon F; Santangelo, Thomas J; Cunningham, Candice K; Roberts, Jeffrey W; Erie, Dorothy A.

J Biol Chem ; 281(27): 18677-83, 2006 Jul 07.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-16621791

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20.

RNA-mediated destabilization of the sigma(70) region 4/beta flap interaction facilitates engagement of RNA polymerase by the Q antiterminator.

Nickels, Bryce E; Roberts, Christine W; Roberts, Jeffrey W; Hochschild, Ann.

Mol Cell ; 24(3): 457-68, 2006 Nov 03.

Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-17081994

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