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1.
Mol Cell ; 72(5): 902-915.e7, 2018 12 06.
Artículo en Inglés | MEDLINE | ID: mdl-30392928

RESUMEN

Chromatin adopts a diversity of regular and irregular fiber structures in vitro and in vivo. However, how an array of nucleosomes folds into and switches between different fiber conformations is poorly understood. We report the 9.7 Å resolution crystal structure of a 6-nucleosome array bound to linker histone H1 determined under ionic conditions that favor incomplete chromatin condensation. The structure reveals a flat two-start helix with uniform nucleosomal stacking interfaces and a nucleosome packing density that is only half that of a twisted 30-nm fiber. Hydroxyl radical footprinting indicates that H1 binds the array in an on-dyad configuration resembling that observed for mononucleosomes. Biophysical, cryo-EM, and crosslinking data validate the crystal structure and reveal that a minor change in ionic environment shifts the conformational landscape to a more compact, twisted form. These findings provide insights into the structural plasticity of chromatin and suggest a possible assembly pathway for a 30-nm fiber.


Asunto(s)
ADN/química , Histonas/química , Proteína 1 de Ensamblaje de Nucleosomas/química , Nucleosomas/ultraestructura , Animales , Sitios de Unión , Clonación Molecular , Microscopía por Crioelectrón , Cristalografía por Rayos X , ADN/genética , ADN/metabolismo , Escherichia coli/genética , Escherichia coli/metabolismo , Expresión Génica , Vectores Genéticos/química , Vectores Genéticos/metabolismo , Histonas/genética , Histonas/metabolismo , Humanos , Radical Hidroxilo/química , Modelos Moleculares , Proteína 1 de Ensamblaje de Nucleosomas/genética , Proteína 1 de Ensamblaje de Nucleosomas/metabolismo , Nucleosomas/química , Nucleosomas/metabolismo , Concentración Osmolar , Unión Proteica , Conformación Proteica en Hélice alfa , Conformación Proteica en Lámina beta , Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas , Multimerización de Proteína , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/genética , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Xenopus laevis
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