Detalles de la búsqueda
1.
Causes of evolutionary rate variation among protein sites.
Nat Rev Genet
; 17(2): 109-21, 2016 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26781812
2.
Relative Model Fit Does Not Predict Topological Accuracy in Single-Gene Protein Phylogenetics.
Mol Biol Evol
; 37(7): 2110-2123, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32191313
3.
HyPhy 2.5-A Customizable Platform for Evolutionary Hypothesis Testing Using Phylogenies.
Mol Biol Evol
; 37(1): 295-299, 2020 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31504749
4.
Relative Evolutionary Rates in Proteins Are Largely Insensitive to the Substitution Model.
Mol Biol Evol
; 35(9): 2307-2317, 2018 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29924340
5.
Datamonkey 2.0: A Modern Web Application for Characterizing Selective and Other Evolutionary Processes.
Mol Biol Evol
; 35(3): 773-777, 2018 Mar 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29301006
6.
Extensively Parameterized Mutation-Selection Models Reliably Capture Site-Specific Selective Constraint.
Mol Biol Evol
; 33(11): 2990-3002, 2016 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27512115
7.
The relationship between dN/dS and scaled selection coefficients.
Mol Biol Evol
; 32(4): 1097-108, 2015 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25576365
8.
Limited utility of residue masking for positive-selection inference.
Mol Biol Evol
; 31(9): 2496-500, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24899665
9.
Predicting evolutionary site variability from structure in viral proteins: buriedness, packing, flexibility, and design.
J Mol Evol
; 79(3-4): 130-42, 2014 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25217382
10.
Membrane environment imposes unique selection pressures on transmembrane domains of G protein-coupled receptors.
J Mol Evol
; 76(3): 172-82, 2013 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23355009
11.
OpenPBTA: The Open Pediatric Brain Tumor Atlas.
Cell Genom
; 3(7): 100340, 2023 Jul 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37492101
12.
Mineral Element Insiders and Outliers Play Crucial Roles in Biological Evolution.
Life (Basel)
; 12(7)2022 Jun 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35888041
13.
The expanding network of mineral chemistry throughout earth history reveals global shifts in crustal chemistry during the Proterozoic.
Sci Rep
; 12(1): 4956, 2022 Mar 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35322071
14.
Relative model selection of evolutionary substitution models can be sensitive to multiple sequence alignment uncertainty.
BMC Ecol Evol
; 21(1): 214, 2021 11 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34844571
15.
The evolving redox chemistry and bioavailability of vanadium in deep time.
Geobiology
; 18(2): 127-138, 2020 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32048807
16.
Evolution of Viral Genomes: Interplay Between Selection, Recombination, and Other Forces.
Methods Mol Biol
; 1910: 427-468, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31278673
17.
Relative evolutionary rate inference in HyPhy with LEISR.
PeerJ
; 6: e4339, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29423346
18.
Gain-of-function experiments with bacteriophage lambda uncover residues under diversifying selection in nature.
Evolution
; 72(10): 2234-2243, 2018 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30152871
19.
Computational prediction of the tolerance to amino-acid deletion in green-fluorescent protein.
PLoS One
; 12(4): e0164905, 2017.
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| MEDLINE | ID: mdl-28369116
20.
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F1000Res
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Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29167739