Detalles de la búsqueda
1.
Investigating RNA-RNA interactions through computational and biophysical analysis.
Nucleic Acids Res
; 51(9): 4588-4601, 2023 05 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36999609
2.
The 3' terminal region of Zika virus RNA contains a conserved G-quadruplex and is unfolded by human DDX17.
Biochem Cell Biol
; 102(1): 96-105, 2024 Feb 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37774422
3.
Biophysical characterisation of human LincRNA-p21 sense and antisense Alu inverted repeats.
Nucleic Acids Res
; 50(10): 5881-5898, 2022 06 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35639511
4.
Strukturierte RNAs in Viren.
Biospektrum (Heidelb)
; 29(2): 156-158, 2023.
Artículo
en Alemán
| MEDLINE | ID: mdl-37073323
5.
Insights into the secondary and tertiary structure of the Bovine Viral Diarrhea Virus Internal Ribosome Entry Site.
RNA Biol
; 19(1): 496-506, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35380920
6.
Interplay between the catabolite repression control protein Crc, Hfq and RNA in Hfq-dependent translational regulation in Pseudomonas aeruginosa.
Nucleic Acids Res
; 46(3): 1470-1485, 2018 02 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29244160
7.
Indications for a moonlighting function of translation factor aIF5A in the crenarchaeum Sulfolobus solfataricus.
RNA Biol
; 16(5): 675-685, 2019 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30777488
8.
Efficient computation of co-transcriptional RNA-ligand interaction dynamics.
Methods
; 143: 70-76, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29730250
9.
In silico design of ligand triggered RNA switches.
Methods
; 143: 90-101, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29660485
10.
The SmAP1/2 proteins of the crenarchaeon Sulfolobus solfataricus interact with the exosome and stimulate A-rich tailing of transcripts.
Nucleic Acids Res
; 45(13): 7938-7949, 2017 Jul 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28520934
11.
The MazF-regulon: a toolbox for the post-transcriptional stress response in Escherichia coli.
Nucleic Acids Res
; 44(14): 6660-75, 2016 08 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26908653
12.
NMR Structural Profiling of Transcriptional Intermediates Reveals Riboswitch Regulation by Metastable RNA Conformations.
J Am Chem Soc
; 139(7): 2647-2656, 2017 02 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28134517
13.
SHAPE directed RNA folding.
Bioinformatics
; 32(1): 145-7, 2016 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26353838
14.
Predicting RNA secondary structures from sequence and probing data.
Methods
; 103: 86-98, 2016 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27064083
15.
Memory-efficient RNA energy landscape exploration.
Bioinformatics
; 30(18): 2584-91, 2014 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24833804
16.
TSSAR: TSS annotation regime for dRNA-seq data.
BMC Bioinformatics
; 15: 89, 2014 Mar 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24674136
17.
A framework for automated scalable designation of viral pathogen lineages from genomic data.
Nat Microbiol
; 9(2): 550-560, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38316930
18.
BarMap: RNA folding on dynamic energy landscapes.
RNA
; 16(7): 1308-16, 2010 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20504954
19.
Evolutionary traits of Tick-borne encephalitis virus: Pervasive non-coding RNA structure conservation and molecular epidemiology.
Virus Evol
; 8(1): veac051, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35822110
20.
Caveats to Deep Learning Approaches to RNA Secondary Structure Prediction.
Front Bioinform
; 2: 835422, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36304289