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Polymorphism in cathelicidin gene (CAMP) that alters Hypoxia-inducible factor (HIF-1α::ARNT) binding is not associated with tuberculosis.

López Campos, G N; Velarde Félix, J S; Sandoval Ramírez, L; Cázares Salazar, S; Corona Nakamura, A L; Amaya Tapia, G; Prado Montes de Oca, E.

Int J Immunogenet ; 41(1): 54-62, 2014 Feb.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-23953711

RESUMO

Polymorphisms in the CAMP gene (cathelicidin) have not been tested in tuberculosis susceptibility. We tested polymorphisms rs9844812 (HIF-1α::ARNT binding site) and rs56122065 (CAMP) plus rs1800972 (DEFB1). SNP rs1800972 was associated with extrapulmonary tuberculosis (EPTB) in a codominant model (genotype CG, P = 0.037, OR 4.82; 95% CI: 0.92-47.42; statistical power, 82%), but not PTB (P = 0.101) in a Mexican population.

Assuntos

Peptídeos Catiônicos Antimicrobianos/genética , Predisposição Genética para Doença , Subunidade alfa do Fator 1 Induzível por Hipóxia/genética , Polimorfismo Genético , Tuberculose/genética , Regiões 5' não Traduzidas , Alelos , Sequência de Aminoácidos , Peptídeos Catiônicos Antimicrobianos/química , Translocador Nuclear Receptor Aril Hidrocarboneto/genética , Translocador Nuclear Receptor Aril Hidrocarboneto/metabolismo , Sequência de Bases , Sítios de Ligação , Estudos de Casos e Controles , Éxons , Frequência do Gene , Genótipo , Humanos , Subunidade alfa do Fator 1 Induzível por Hipóxia/metabolismo , Dados de Sequência Molecular , Motivos de Nucleotídeos , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Matrizes de Pontuação de Posição Específica , Regiões Promotoras Genéticas , Ligação Proteica , Tuberculose/metabolismo , Tuberculose Pulmonar/genética , Tuberculose Pulmonar/metabolismo , beta-Defensinas/genética , Catelicidinas

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