ChimeraScan: a tool for identifying chimeric transcription in sequencing data.
Bioinformatics
; 27(20): 2903-4, 2011 Oct 15.
Article
en En
| MEDLINE
| ID: mdl-21840877
ABSTRACT
SUMMARY:
Next generation sequencing (NGS) technologies have enabled de novo gene fusion discovery that could reveal candidates with therapeutic significance in cancer. Here we present an open-source software package, ChimeraScan, for the discovery of chimeric transcription between two independent transcripts in high-throughput transcriptome sequencing data.AVAILABILITY:
http//chimerascan.googlecode.com CONTACT cmaher@dom.wustl.edu SUPPLEMENTARY INFORMATION Supplementary data are available at Bioinformatics online.
Texto completo:
1
Colección:
01-internacional
Banco de datos:
MEDLINE
Asunto principal:
Programas Informáticos
/
Análisis de Secuencia de ARN
/
Fusión Génica
/
Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento
/
Neoplasias
Límite:
Humans
Idioma:
En
Revista:
Bioinformatics
Asunto de la revista:
INFORMATICA MEDICA
Año:
2011
Tipo del documento:
Article
País de afiliación:
Estados Unidos