Large scale explorative oligonucleotide probe selection for thousands of genetic groups on a computing grid: application to phylogenetic probe design using a curated small subunit ribosomal RNA gene database.

Jaziri, Faouzi; Peyretaillade, Eric; Missaoui, Mohieddine; Parisot, Nicolas; Cipière, Sébastien; Denonfoux, Jérémie; Mahul, Antoine; Peyret, Pierre; Hill, David R C

Jaziri, Faouzi; Peyretaillade, Eric; Missaoui, Mohieddine; Parisot, Nicolas; Cipière, Sébastien; Denonfoux, Jérémie; Mahul, Antoine; Peyret, Pierre; Hill, David R C.

Afiliación

Jaziri F; UMR CNRS 6158, ISIMA/LIMOS, Clermont Université et Université Blaise Pascal, F63173 Aubière, France ; Clermont Université et Université d'Auvergne, EA 4678 CIDAM, BP 10448, F63001 Clermont-Ferrand Cedex 1, France.
Peyretaillade E; Clermont Université et Université d'Auvergne, EA 4678 CIDAM, BP 10448, F63001 Clermont-Ferrand Cedex 1, France ; Clermont Université et Université d'Auvergne, UFR Pharmacie, F63001 Clermont-Ferrand Cedex 1, France.
Missaoui M; UMR CNRS 6158, ISIMA/LIMOS, Clermont Université et Université Blaise Pascal, F63173 Aubière, France ; Clermont Université et Université d'Auvergne, EA 4678 CIDAM, BP 10448, F63001 Clermont-Ferrand Cedex 1, France.
Parisot N; Clermont Université et Université d'Auvergne, EA 4678 CIDAM, BP 10448, F63001 Clermont-Ferrand Cedex 1, France ; CNRS, UMR 6023, LMGE, F63171 Aubière, France.
Cipière S; UMR CNRS 6158, ISIMA/LIMOS, Clermont Université et Université Blaise Pascal, F63173 Aubière, France.
Denonfoux J; Clermont Université et Université d'Auvergne, EA 4678 CIDAM, BP 10448, F63001 Clermont-Ferrand Cedex 1, France ; CNRS, UMR 6023, LMGE, F63171 Aubière, France.
Mahul A; Clermont Université, CRRI, F63177 Aubière, France.
Peyret P; Clermont Université et Université d'Auvergne, EA 4678 CIDAM, BP 10448, F63001 Clermont-Ferrand Cedex 1, France ; Clermont Université et Université d'Auvergne, UFR Pharmacie, F63001 Clermont-Ferrand Cedex 1, France.
Hill DR; UMR CNRS 6158, ISIMA/LIMOS, Clermont Université et Université Blaise Pascal, F63173 Aubière, France.

ScientificWorldJournal ; 2014: 350487, 2014.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-24516366

Asunto(s)

Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos/métodos; Sondas de Oligonucleótidos; Programas Informáticos; Algoritmos; Biología Computacional/métodos; Bases de Datos de Ácidos Nucleicos; Genes de ARNr; Filogenia

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Sondas de Oligonucleótidos / Análisis de Secuencia por Matrices de Oligonucleótidos Idioma: En Revista: ScientificWorldJournal Asunto de la revista: MEDICINA Año: 2014 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia

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