OTG-snpcaller: an optimized pipeline based on TMAP and GATK for SNP calling from ion torrent data.

Zhu, Pengyuan; He, Lingyu; Li, Yaqiao; Huang, Wenpan; Xi, Feng; Lin, Lin; Zhi, Qihuan; Zhang, Wenwei; Tang, Y Tom; Geng, Chunyu; Lu, Zhiyuan; Xu, Xun

Zhu, Pengyuan; He, Lingyu; Li, Yaqiao; Huang, Wenpan; Xi, Feng; Lin, Lin; Zhi, Qihuan; Zhang, Wenwei; Tang, Y Tom; Geng, Chunyu; Lu, Zhiyuan; Xu, Xun.

Afiliación

Zhu P; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.
He L; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.
Li Y; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.
Huang W; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.
Xi F; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.
Lin L; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.
Zhi Q; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.
Zhang W; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.
Tang YT; Complete Genomics, Inc., Mountain View, California, United States of America.
Geng C; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.
Lu Z; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.
Xu X; BGI-Shenzhen, Shenzhen, China.

PLoS One ; 9(5): e97507, 2014.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-24824529

Asunto(s)

Genoma Humano/genética; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Polimorfismo de Nucleótido Simple/genética; Análisis de Secuencia de ADN/instrumentación; Análisis de Secuencia de ADN/métodos; Programas Informáticos; Secuencia de Bases; Exoma/genética; Humanos; Datos de Secuencia Molecular; Alineación de Secuencia/métodos

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Genoma Humano / Análisis de Secuencia de ADN / Polimorfismo de Nucleótido Simple / Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento Tipo de estudio: Guideline Límite: Humans Idioma: En Revista: PLoS One Asunto de la revista: CIENCIA / MEDICINA Año: 2014 Tipo del documento: Article País de afiliación: China

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