Multiple mutations in RNA polymerase ß-subunit gene (rpoB) in Streptomyces incarnatus NRRL8089 enhance production of antiviral antibiotic sinefungin: modeling rif cluster region by density functional theory.

Ogawa, Saori; Shimidzu, Hitomi; Fukuda, Koji; Tsunekawa, Naoki; Hirano, Toshiyuki; Sato, Fumitoshi; Yura, Kei; Hasunuma, Tomohisa; Ochi, Kozo; Yamamoto, Michio; Sakamoto, Wataru; Hashimoto, Kentaro; Ogata, Hiroyuki; Kanao, Tadayoshi; Nemoto, Michiko; Inagaki, Kenji; Tamura, Takashi

Ogawa, Saori; Shimidzu, Hitomi; Fukuda, Koji; Tsunekawa, Naoki; Hirano, Toshiyuki; Sato, Fumitoshi; Yura, Kei; Hasunuma, Tomohisa; Ochi, Kozo; Yamamoto, Michio; Sakamoto, Wataru; Hashimoto, Kentaro; Ogata, Hiroyuki; Kanao, Tadayoshi; Nemoto, Michiko; Inagaki, Kenji; Tamura, Takashi.

Afiliación

Ogawa S; The Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Japan.
Shimidzu H; The Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Japan.
Fukuda K; The Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Japan.
Tsunekawa N; Institute for Quantitative Biosciences, The University of Tokyo, Bunkyo-ku, Japan.
Hirano T; Institute of Industrial Science, The University of Tokyo, Komaba, Japan.
Sato F; Institute of Industrial Science, The University of Tokyo, Komaba, Japan.
Yura K; Graduate School of Humanities and Sciences, Ochanomizu University, Tokyo, Japan.
Hasunuma T; Graduate School of Science, Technology and Innovation, Kobe University, Kobe, Japan.
Ochi K; The Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Japan.
Yamamoto M; The Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Japan.
Sakamoto W; RIKEN AIP, Tokyo, Japan.
Hashimoto K; The Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Japan.
Ogata H; Bioinformatics Center, Institute for Chemical Research, Kyoto University, Uji, Kyoto, Japan.
Kanao T; Bioinformatics Center, Institute for Chemical Research, Kyoto University, Uji, Kyoto, Japan.
Nemoto M; The Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Japan.
Inagaki K; The Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Japan.
Tamura T; The Graduate School of Environmental and Life Science, Okayama University, Okayama, Japan.

Biosci Biotechnol Biochem ; 85(5): 1275-1282, 2021 Apr 24.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33710298

Asunto(s)

Adenosina/análogos & derivados; Antibacterianos/biosíntesis; Proteínas Bacterianas/genética; ARN Polimerasas Dirigidas por ADN/genética; Mutación; Streptomyces/genética; Adenosina/biosíntesis; Adenosina/química; Sustitución de Aminoácidos; Antibacterianos/química; Antifúngicos/química; Antifúngicos/metabolismo; Antimaláricos/química; Antimaláricos/metabolismo; Antiprotozoarios/química; Antiprotozoarios/metabolismo; Antivirales/química; Antivirales/metabolismo; Proteínas Bacterianas/química; Proteínas Bacterianas/metabolismo; Sitios de Unión; ADN/química; ADN/genética; ADN/metabolismo; ARN Polimerasas Dirigidas por ADN/química; ARN Polimerasas Dirigidas por ADN/metabolismo; Teoría Funcional de la Densidad; Regulación Bacteriana de la Expresión Génica; Simulación de Dinámica Molecular; Unión Proteica; Conformación Proteica en Hélice alfa; Conformación Proteica en Lámina beta; Dominios y Motivos de Interacción de Proteínas; ARN Mensajero/química; ARN Mensajero/genética; ARN Mensajero/metabolismo; Streptomyces/enzimología

Palabras clave

rpoB mutation; antiviral antibiotics; density functional theory; molecular dynamics simulation; sparse regression

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Streptomyces / Proteínas Bacterianas / ARN Polimerasas Dirigidas por ADN / Adenosina / Antibacterianos / Mutación Idioma: En Revista: Biosci Biotechnol Biochem Asunto de la revista: BIOQUIMICA / BIOTECNOLOGIA Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Japón

Texto completo

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google