Combining Nanopore and Illumina Sequencing Permits Detailed Analysis of Insertion Mutations and Structural Variations Produced by PEG-Mediated Transformation in <i>Ostreococcus tauri</i>.

Thomy, Julie; Sanchez, Frederic; Gut, Marta; Cruz, Fernando; Alioto, Tyler; Piganeau, Gwenael; Grimsley, Nigel; Yau, Sheree

Combining Nanopore and Illumina Sequencing Permits Detailed Analysis of Insertion Mutations and Structural Variations Produced by PEG-Mediated Transformation in Ostreococcus tauri.

Thomy, Julie; Sanchez, Frederic; Gut, Marta; Cruz, Fernando; Alioto, Tyler; Piganeau, Gwenael; Grimsley, Nigel; Yau, Sheree.

Afiliación

Thomy J; Sorbonne Université, CNRS, UMR 7232 Biologie Intégrative des Organismes Marins (BIOM), Observatoire Océanologique, F-66650 Banyuls-sur-Mer, France.
Sanchez F; Sorbonne Université, CNRS, UMR 7232 Biologie Intégrative des Organismes Marins (BIOM), Observatoire Océanologique, F-66650 Banyuls-sur-Mer, France.
Gut M; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Baldiri i Reixac 4, 08028 Barcelona, Spain.
Cruz F; Universitat Pompeu Fabra (UPF), 08003 Barcelona, Spain.
Alioto T; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Baldiri i Reixac 4, 08028 Barcelona, Spain.
Piganeau G; CNAG-CRG, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Baldiri i Reixac 4, 08028 Barcelona, Spain.
Grimsley N; Universitat Pompeu Fabra (UPF), 08003 Barcelona, Spain.
Yau S; Sorbonne Université, CNRS, UMR 7232 Biologie Intégrative des Organismes Marins (BIOM), Observatoire Océanologique, F-66650 Banyuls-sur-Mer, France.

Cells ; 10(3)2021 03 17.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-33802698

Asunto(s)

Chlorophyta/genética; Reparación del ADN/genética; Genoma/genética; Mutación/genética; Reparación del ADN/fisiología; Genómica; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos; Mutagénesis Insercional/métodos; Nanoporos

Palabras clave

Chlorophyta; DNA repair; Mamiellophyceae; NGS; NHEJ; copy number; polyethylene glycol; random insertional mutagenesis; structural variations; unknown sequences

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Genoma / Reparación del ADN / Chlorophyta / Mutación Idioma: En Revista: Cells Año: 2021 Tipo del documento: Article País de afiliación: Francia

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