rprimer: an R/bioconductor package for design of degenerate oligos for sequence variable viruses.

Persson, Sofia; Larsson, Christina; Simonsson, Magnus; Ellström, Patrik

Persson, Sofia; Larsson, Christina; Simonsson, Magnus; Ellström, Patrik.

Afiliación

Persson S; European Union Reference Laboratory for Foodborne Viruses, Swedish Food Agency, Dag Hammarskjölds väg 56 A, 752 37, Uppsala, Sweden. sofia.persson@slv.se.
Larsson C; Department of Medical Sciences, Zoonosis Science Centre, Uppsala University, Uppsala, Sweden. sofia.persson@slv.se.
Simonsson M; Section of Clinical Virology, Department of Medical Sciences, Uppsala University, Uppsala, Sweden.
Ellström P; European Union Reference Laboratory for Foodborne Viruses, Swedish Food Agency, Dag Hammarskjölds väg 56 A, 752 37, Uppsala, Sweden.

BMC Bioinformatics ; 23(1): 239, 2022 Jun 18.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-35717145

Asunto(s)

Norovirus; Cartilla de ADN/genética; Norovirus/genética; Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa/métodos; Alineación de Secuencia

Palabras clave

Degenerate primers; Digital PCR; Genotyping; Norovirus; PCR; Primer design; RT-PCR; Sequence variable virus; qPCR

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Banco de datos: MEDLINE Asunto principal: Norovirus Tipo de estudio: Prognostic_studies Idioma: En Revista: BMC Bioinformatics Asunto de la revista: INFORMATICA MEDICA Año: 2022 Tipo del documento: Article País de afiliación: Suecia

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