Digital transcriptome profiling using selective hexamer priming for cDNA synthesis.
Nat Methods
; 6(9): 647-9, 2009 Sep.
Article
em En
| MEDLINE
| ID: mdl-19668204
ABSTRACT
We developed a procedure for the preparation of whole transcriptome cDNA libraries depleted of ribosomal RNA from only 1 microg of total RNA. The method relies on a collection of short, computationally selected oligonucleotides, called 'not-so-random' (NSR) primers, to obtain full-length, strand-specific representation of nonribosomal RNA transcripts. In this study we validated the technique by profiling human whole brain and universal human reference RNA using ultra-high-throughput sequencing.
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1
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01-internacional
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MEDLINE
Assunto principal:
Encéfalo
/
Biblioteca Gênica
/
DNA Complementar
/
Perfilação da Expressão Gênica
Limite:
Humans
Idioma:
En
Revista:
Nat Methods
Assunto da revista:
TECNICAS E PROCEDIMENTOS DE LABORATORIO
Ano de publicação:
2009
Tipo de documento:
Article
País de afiliação:
Estados Unidos