Simple and accurate single base resolution analysis of 5-hydroxymethylcytosine by catalytic oxidative bisulfite sequencing using micelle incarcerated oxidants.

Fukuzawa, Seketsu; Takahashi, Saori; Tachibana, Kazuo; Tajima, Shoji; Suetake, Isao

Fukuzawa, Seketsu; Takahashi, Saori; Tachibana, Kazuo; Tajima, Shoji; Suetake, Isao.

Afiliação

Fukuzawa S; Department of Chemistry, School of Science, The University of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, Japan; CREST, Japan Agency for Medical Research and Development (AMED), 1-7-1 Otemachi, Chiyoda-ku, Tokyo 100-0004, Japan. Electronic address: seketsuf@chem.s.u-tokyo.ac.jp.
Takahashi S; Laboratory of Epigenetics, Institute for Protein Research, Osaka University, 3-2 Yamadaoka, Suita, Osaka 565-0871, Japan.
Tachibana K; Department of Chemistry, School of Science, The University of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, Japan.
Tajima S; Laboratory of Epigenetics, Institute for Protein Research, Osaka University, 3-2 Yamadaoka, Suita, Osaka 565-0871, Japan.
Suetake I; CREST, Japan Agency for Medical Research and Development (AMED), 1-7-1 Otemachi, Chiyoda-ku, Tokyo 100-0004, Japan; Laboratory of Epigenetics, Institute for Protein Research, Osaka University, 3-2 Yamadaoka, Suita, Osaka 565-0871, Japan. Electronic address: suetake@protein.osaka-u.ac.jp.

Bioorg Med Chem ; 24(18): 4254-4262, 2016 09 15.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-27460669

Assuntos

5-Metilcitosina/análogos & derivados; Oxidantes/química; Análise de Sequência de DNA/métodos; 5-Metilcitosina/química; Adamantano/análogos & derivados; Adamantano/química; Animais; Óxidos N-Cíclicos/química; Citosina/análogos & derivados; Citosina/química; DNA de Cadeia Simples/química; Células-Tronco Embrionárias; Iodobenzenos/química; Camundongos; Micelas; Oniocompostos/química; Oxirredução; Dodecilsulfato de Sódio/química; Sulfitos/química; Temperatura

Palavras-chave

5-Hydroxymethylcytosine; Bisulfite sequencing; DNA demethylation; Oxidation; Single base resolution

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Oxidantes / Análise de Sequência de DNA / 5-Metilcitosina Limite: Animals Idioma: En Revista: Bioorg Med Chem Assunto da revista: BIOQUIMICA / QUIMICA Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

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