Sediment-associated bacterial community and predictive functionalities are influenced by choice of 16S ribosomal RNA hypervariable region(s): An amplicon-based diversity study.

Rajeev, Meora; Sushmitha, T J; Toleti, Subba Rao; Pandian, Shunmugiah Karutha

Rajeev, Meora; Sushmitha, T J; Toleti, Subba Rao; Pandian, Shunmugiah Karutha.

Afiliação

Rajeev M; Department of Biotechnology, Alagappa University, Science Campus, Karaikudi 630 003, Tamil Nadu, India.
Sushmitha TJ; Department of Biotechnology, Alagappa University, Science Campus, Karaikudi 630 003, Tamil Nadu, India.
Toleti SR; Water and Steam Chemistry Division, Bhabha Atomic Research Centre Facilities, Kalpakkam 603 102, Tamil Nadu, India.
Pandian SK; Department of Biotechnology, Alagappa University, Science Campus, Karaikudi 630 003, Tamil Nadu, India. Electronic address: sk_pandian@alagappauniversity.ac.in.

Genomics ; 112(6): 4968-4979, 2020 11.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-32911024

Assuntos

Bactérias/isolamento & purificação; Sedimentos Geológicos/microbiologia; RNA Ribossômico 16S/genética; Bactérias/classificação; Bactérias/genética; Biodiversidade; Variação Genética; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Microbiota; Análise de Sequência de DNA

Palavras-chave

16S hypervariable regions; Amplicon sequencing; Marine sediments; Predictive functionality

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / RNA Ribossômico 16S / Sedimentos Geológicos Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Genomics Assunto da revista: GENETICA Ano de publicação: 2020 Tipo de documento: Article País de afiliação: Índia

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