A comprehensive survey of regulatory network inference methods using single cell RNA sequencing data.

Nguyen, Hung; Tran, Duc; Tran, Bang; Pehlivan, Bahadir; Nguyen, Tin

Nguyen, Hung; Tran, Duc; Tran, Bang; Pehlivan, Bahadir; Nguyen, Tin.

Afiliação

Nguyen H; Department of Computer Science and Engineering, University of Nevada, Reno, NV 89557.
Tran D; Department of Computer Science and Engineering, University of Nevada, Reno, NV 89557.
Tran B; Department of Computer Science and Engineering, University of Nevada, Reno, NV 89557.
Pehlivan B; Department of Computer Science and Engineering, University of Nevada, Reno, NV 89557.
Nguyen T; Department of Computer Science and Engineering, University of Nevada, Reno, NV 89557.

Brief Bioinform ; 22(3)2021 05 20.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34020546

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Redes Reguladoras de Genes; Análise de Sequência de RNA/métodos; Análise de Célula Única/métodos; Algoritmos; Humanos; Modelos Genéticos; Reprodutibilidade dos Testes; Software

Palavras-chave

RNA sequencing; gene regulatory network; scRNA-seq; simulation studies; single-cell data

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Sequência de RNA / Biologia Computacional / Perfilação da Expressão Gênica / Redes Reguladoras de Genes / Análise de Célula Única Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: Brief Bioinform Assunto da revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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