Performance evaluation of transcriptomics data normalization for survival risk prediction.

Ni, Ai; Qin, Li-Xuan

Ni, Ai; Qin, Li-Xuan.

Afiliação

Ni A; Ohio State University, New York, NY 10017 USA.
Qin LX; Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, NY 10017 USA.

Brief Bioinform ; 22(6)2021 11 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34245143

Assuntos

Biomarcadores; Biologia Computacional/métodos; Perfilação da Expressão Gênica/métodos; Transcriptoma; Algoritmos; Regulação da Expressão Gênica; MicroRNAs/genética; Mortalidade; Prognóstico; Modelos de Riscos Proporcionais

Palavras-chave

data normalization; handling effects; microRNA microarray; penalized Cox regression; survival prediction; transcriptomics data

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Biomarcadores / Biologia Computacional / Perfilação da Expressão Gênica / Transcriptoma Tipo de estudo: Etiology_studies / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Brief Bioinform Assunto da revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article

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