Application and Challenge of 3rd Generation Sequencing for Clinical Bacterial Studies.

Ben Khedher, Mariem; Ghedira, Kais; Rolain, Jean-Marc; Ruimy, Raymond; Croce, Olivier

Ben Khedher, Mariem; Ghedira, Kais; Rolain, Jean-Marc; Ruimy, Raymond; Croce, Olivier.

Afiliação

Ben Khedher M; Bacteriology Laboratory, Archet 2 Hospital, CHU Nice, 06000 Nice, France.
Ghedira K; Institute for Research on Cancer and Aging Nice (IRCAN), CNRS, INSERM, Université Côte d'Azur, 06108 Nice, France.
Rolain JM; Laboratory of Bioinformatics, Biomathematics and Biostatistics, Institute Pasteur of Tunis, Tunis 1002, Tunisia.
Ruimy R; IRD, APHM, MEPHI, IHU-Méditerranée Infection, Aix Marseille Université, 13005 Marseille, France.
Croce O; Bacteriology Laboratory, Archet 2 Hospital, CHU Nice, 06000 Nice, France.

Int J Mol Sci ; 23(3)2022 Jan 26.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-35163319

Assuntos

Bactérias/genética; Genoma Bacteriano/genética; Animais; Biologia Computacional/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/métodos; Humanos; Metagenômica/métodos; Epidemiologia Molecular; Sequenciamento Completo do Genoma/métodos

Palavras-chave

bacterial genomes; genomics; long-read sequencing; metagenomics; metatranscriptomics; next-generation sequencing; transcriptomics; whole-genome sequencing (WGS)

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Bactérias / Genoma Bacteriano Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Int J Mol Sci Ano de publicação: 2022 Tipo de documento: Article País de afiliação: França

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