Detalhe da pesquisa
1.
Cell region fingerprints enable highly precise single-cell tracking and lineage reconstruction.
Nat Methods
; 19(10): 1276-1285, 2022 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36138173
2.
Model-based inference of neutralizing antibody avidities against influenza virus.
PLoS Pathog
; 18(1): e1010243, 2022 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35100312
3.
Assumptions on decision making and environment can yield multiple steady states in microbial community models.
BMC Bioinformatics
; 24(Suppl 1): 262, 2023 Jun 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37349675
4.
Efficient design of synthetic gene circuits under cell-to-cell variability.
BMC Bioinformatics
; 24(Suppl 1): 460, 2023 Dec 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38062373
5.
PolyRound: polytope rounding for random sampling in metabolic networks.
Bioinformatics
; 38(2): 566-567, 2022 01 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34329395
6.
Cellular and computational models reveal environmental and metabolic interactions in MMUT-type methylmalonic aciduria.
J Inherit Metab Dis
; 46(3): 421-435, 2023 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36371683
7.
Model-based integration of genomics and metabolomics reveals SNP functionality in Mycobacterium tuberculosis.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(15): 8494-8502, 2020 04 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32229570
8.
Association of Host Factors With Antibody Response to Seasonal Influenza Vaccination in Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplant Patients.
J Infect Dis
; 225(8): 1482-1493, 2022 04 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34415049
9.
Probabilistic thermodynamic analysis of metabolic networks.
Bioinformatics
; 37(18): 2938-2945, 2021 09 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33755125
10.
A synthetic multifunctional mammalian pH sensor and CO2 transgene-control device.
Mol Cell
; 55(3): 397-408, 2014 Aug 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25018017
11.
Inflammatory signals directly instruct PU.1 in HSCs via TNF.
Blood
; 133(8): 816-819, 2019 02 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30301719
12.
TopoFilter: a MATLAB package for mechanistic model identification in systems biology.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 34, 2020 Jan 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31996136
13.
Controlling cell-to-cell variability with synthetic gene circuits.
Biochem Soc Trans
; 47(6): 1795-1804, 2019 12 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31803907
14.
Steady-State Differential Dose Response in Biological Systems.
Biophys J
; 114(3): 723-736, 2018 02 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29414717
15.
Inferring causal metabolic signals that regulate the dynamic TORC1-dependent transcriptome.
Mol Syst Biol
; 11(4): 802, 2015 Apr 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25888284
16.
Efficient Characterization of Parametric Uncertainty of Complex (Bio)chemical Networks.
PLoS Comput Biol
; 11(8): e1004457, 2015 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26317784
17.
A tunable synthetic mammalian oscillator.
Nature
; 457(7227): 309-12, 2009 Jan 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19148099
18.
Cutting the wires: modularization of cellular networks for experimental design.
Biophys J
; 106(1): 321-31, 2014 Jan 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24411264
19.
Bridging the gaps in systems biology.
Mol Genet Genomics
; 289(5): 727-34, 2014 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24728588
20.
Near-optimal experimental design for model selection in systems biology.
Bioinformatics
; 29(20): 2625-32, 2013 Oct 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23900189