Análise da anotação funcional e expressão gênica diferencial da família de proteínas WD de Trypanosoma cruzi / Analysis of the functional notation and distinguishing genics expression of the protein family WD of Trypanosoma cruzi

RESUMO

As proteínas contendo módulos WD representam um dos grupos funcionais mais comuns em Trypanosoma cruzi. Esse módulo, geralmente encontrado em repetições, se estende por aproximadamente 40 aminoácidos, geralmente terminando em um dipeptídeo triptofano-ácido aspártico (WD), sendo que as repetições possivelmente formam uma estrutura circularizada do tipo beta-propeller... As funções são amplas, como transdução de sinal, regulação da transcrição, controle do ciclo celular e apoptose. O objetivo do presente trabalho foi identificar as proteínas WD em T. cruzi, organizá-las, descrever e caracterizar elementos característicos das mesmas e avaliar o perfil de expressão diferencial a partir de dados de microarranjo e proteômica...A grande maioria desses supra-genes (81,2 por cento) não apresenta uma anotação funcional de seu produto protéico (isto é, são caracterizadas como proteínas hipotéticas), sendo que os genes contendo anotação funcional estão geralmente associados à citoesqueleto, tráfego de vesículas e sinalização. Uma descrição das características bioinformáticas, bem como a revisão da literatura pertinente, foi realizada para essas 117 proteínas... Uma possibilidade é que essas proteínas atuem somente como arcabouços de complexos multi-protéicos, sendo a determinação da função desse complexo determinada por proteínas associadas; outra hipótese é a existência de módulos funcionais ainda não identificados dentro dessas proteínas. Nesse sentido, a maior parte das proteínas WD de T. cruzi apresenta regiões relativamente grandes de seqüência protéica sem módulos, nas quais podem estar presentes novos determinantes funcionais...A clonagem desses genes diferencialmente expressos, em vetores Gateway(marca registrada), foi iniciada, visando sua caracterização molecular posterior. A partir dos resultados desse trabalho, foi possível sugerir uma anotação funcional a diversas proteínas WD não caracterizadas anteriormente pelo consórcio de seqüenciamento do genoma de T.