Genomic analysis of early murine mammary gland development using novel probe-level algorithms.
Genome Biol
; 6(2): R20, 2005.
Article
em En
| MEDLINE
| ID: mdl-15693949
ABSTRACT
We describe a novel algorithm (ChipStat) for detecting gene-expression changes utilizing probe-level comparisons of replicate Affymetrix oligonucleotide microarray data. A combined detection approach is shown to yield greater sensitivity than a number of widely used methodologies including SAM, dChip and logit-T. Using this approach, we identify alterations in functional pathways during murine neonatal-pubertal mammary development that include the coordinate upregulation of major urinary proteins and the downregulation of loci exhibiting reciprocal imprinting.
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1
Coleções:
01-internacional
Base de dados:
MEDLINE
Assunto principal:
Algoritmos
/
Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos
/
Perfilação da Expressão Gênica
/
Glândulas Mamárias Animais
Limite:
Animals
Idioma:
En
Revista:
Genome Biol
Assunto da revista:
BIOLOGIA MOLECULAR
/
GENETICA
Ano de publicação:
2005
Tipo de documento:
Article
País de afiliação:
Estados Unidos