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Dating the age of admixture via wavelet transform analysis of genome-wide data.
Pugach, Irina; Matveyev, Rostislav; Wollstein, Andreas; Kayser, Manfred; Stoneking, Mark.
Afiliação
  • Pugach I; Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Deutscher Platz 6, Leipzig, D-04103, Germany. irina_pugach@eva.mpg.de.
Genome Biol ; 12(2): R19, 2011.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-21352535
We describe a PCA-based genome scan approach to analyze genome-wide admixture structure, and introduce wavelet transform analysis as a method for estimating the time of admixture. We test the wavelet transform method with simulations and apply it to genome-wide SNP data from eight admixed human populations. The wavelet transform method offers better resolution than existing methods for dating admixture, and can be applied to either SNP or sequence data from humans or other species.
Assuntos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Humano / Dinâmica Populacional / Genômica / Análise de Ondaletas / Genética Populacional Limite: Female / Humans / Male Idioma: En Revista: Genome Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2011 Tipo de documento: Article País de afiliação: Alemanha

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Genoma Humano / Dinâmica Populacional / Genômica / Análise de Ondaletas / Genética Populacional Limite: Female / Humans / Male Idioma: En Revista: Genome Biol Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Ano de publicação: 2011 Tipo de documento: Article País de afiliação: Alemanha