Nuclear transcriptome profiling of induced pluripotent stem cells and embryonic stem cells identify non-coding loci resistant to reprogramming.

Fort, Alexandre; Yamada, Daisuke; Hashimoto, Kosuke; Koseki, Haruhiko; Carninci, Piero

Fort, Alexandre; Yamada, Daisuke; Hashimoto, Kosuke; Koseki, Haruhiko; Carninci, Piero.

Afiliação

Fort A; a Division of Genomic Technologies ; RIKEN Center for Life Science Technologies ; Yokohama , Japan.

Cell Cycle ; 14(8): 1148-55, 2015.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25664506

Assuntos

Núcleo Celular/metabolismo; Reprogramação Celular; Células-Tronco Embrionárias/metabolismo; Células-Tronco Pluripotentes Induzidas/metabolismo; Transcriptoma; Animais; Antígenos CD19/metabolismo; Linfócitos B/citologia; Células Cultivadas; Reprogramação Celular/genética; Análise por Conglomerados; Células-Tronco Embrionárias/citologia; Perfilação da Expressão Gênica; Loci Gênicos; Células-Tronco Pluripotentes Induzidas/citologia; Camundongos; Camundongos Endogâmicos C57BL; RNA não Traduzido/metabolismo

Palavras-chave

CAGE, cap analysis of gene expression; ENCODE, Encyclopedia of DNA Elements; ESC, embryonic stem cells; NAST, Non-Annotated Stem Transcripts; Stem cells; eRNA, enhancer RNA; iPS; iPSC, induced pluripotent stem cells; lncRNA long non-coding RNA; lncRNAs; ncRNA, non-coding RNA; non-coding RNA; pluripotency; super-enhancers; transcriptome

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Núcleo Celular / Células-Tronco Embrionárias / Reprogramação Celular / Células-Tronco Pluripotentes Induzidas / Transcriptoma Tipo de estudo: Guideline Limite: Animals Idioma: En Revista: Cell Cycle Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: Japão

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