Binding affinities of the farnesoid X receptor in the D3R Grand Challenge 2 estimated by free-energy perturbation and docking.

Olsson, Martin A; García-Sosa, Alfonso T; Ryde, Ulf

Olsson, Martin A; García-Sosa, Alfonso T; Ryde, Ulf.

Afiliação

Olsson MA; Department of Theoretical Chemistry, Chemical Centre, Lund University, P. O. Box 124, 221 00, Lund, Sweden.
García-Sosa AT; Institute of Chemistry, University of Tartu, Ravila 14a, 50411, Tartu, Estonia.
Ryde U; Department of Theoretical Chemistry, Chemical Centre, Lund University, P. O. Box 124, 221 00, Lund, Sweden. Ulf.Ryde@teokem.lu.se.

J Comput Aided Mol Des ; 32(1): 211-224, 2018 01.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-28879536

Assuntos

Simulação de Acoplamento Molecular; Receptores Citoplasmáticos e Nucleares/metabolismo; Termodinâmica; Sítios de Ligação; Cristalografia por Raios X; Desenho de Fármacos; Descoberta de Drogas; Humanos; Ligantes; Ligação Proteica; Conformação Proteica; Receptores Citoplasmáticos e Nucleares/química; Software

Palavras-chave

Bennett acceptance ratio; Charge transformations; D3R Grand Challenge 2016; Docking; Drug design data resource; Free-energy perturbation; Ligand binding; Periodic boundary conditions; Quantum-polarised ligand docking

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Termodinâmica / Receptores Citoplasmáticos e Nucleares / Simulação de Acoplamento Molecular Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: J Comput Aided Mol Des Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR / ENGENHARIA BIOMEDICA Ano de publicação: 2018 Tipo de documento: Article País de afiliação: Suécia

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