Chromatin loop anchors predict transcript and exon usage.

Zhang, Yu; Cai, Yichao; Roca, Xavier; Kwoh, Chee Keong; Fullwood, Melissa Jane

Zhang, Yu; Cai, Yichao; Roca, Xavier; Kwoh, Chee Keong; Fullwood, Melissa Jane.

Afiliação

Zhang Y; School of Computer Science and Engineering, Nanyang Technological University, 50 Nanyang Avenue, Singapore, 639798, Singapore.
Cai Y; Cancer Science Institute of Singapore, National University of Singapore, 14 Medical Dr, Singapore 117599, Singapore.
Roca X; School of Biological Sciences, Nanyang Technological University, 60 Nanyang Dr, Singapore 637551, Singapore.
Kwoh CK; School of Computer Science and Engineering, Nanyang Technological University, 50 Nanyang Avenue, Singapore, 639798, Singapore.
Fullwood MJ; Cancer Science Institute of Singapore, National University of Singapore, 14 Medical Dr, Singapore 117599, Singapore.

Brief Bioinform ; 22(6)2021 11 05.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-34263910

Assuntos

Montagem e Desmontagem da Cromatina/genética; Cromatina/genética; Biologia Computacional/métodos; Éxons; Transcrição Gênica; Metilação de DNA; Epigênese Genética; Epigenômica/métodos; Regulação da Expressão Gênica; Histonas/metabolismo; Modelos Biológicos; Reprodutibilidade dos Testes

Palavras-chave

ChIA-PET; alternative splicing; chromatin loop anchors; exon usage; gene expression; histone modifications; machine learning; transcript

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Transcrição Gênica / Cromatina / Éxons / Biologia Computacional / Montagem e Desmontagem da Cromatina Tipo de estudo: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Brief Bioinform Assunto da revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2021 Tipo de documento: Article País de afiliação: Singapura

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