Detalles de la búsqueda
1.
Increasing confidence in proteomic spectral deconvolution through mass defect.
Bioinformatics;
38(22): 5119-5120, 2022 11 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36130273
2.
Top-Down Garbage Collector: a tool for selecting high-quality top-down proteomics mass spectra.
Bioinformatics;
35(18): 3489-3490, 2019 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30715205
3.
Differential proteomic comparison of breast cancer secretome using a quantitative paired analysis workflow.
BMC Cancer;
19(1): 365, 2019 Apr 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30999875
4.
DiagnoProt: a tool for discovery of new molecules by mass spectrometry.
Bioinformatics;
33(12): 1883-1885, 2017 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28186229
5.
Information-theoretic signatures of biodiversity in the barcoding gene.
J Theor Biol;
451: 111-116, 2018 08 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29750998
6.
PepExplorer: a similarity-driven tool for analyzing de novo sequencing results.
Mol Cell Proteomics;
13(9): 2480-9, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24878498
7.
Exploring the proteomic landscape of a gastric cancer biopsy with the shotgun imaging analyzer.
J Proteome Res;
13(1): 314-20, 2014 Jan 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24283986
8.
Effectively addressing complex proteomic search spaces with peptide spectrum matching.
Bioinformatics;
29(10): 1343-4, 2013 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23446294
9.
Improving the TFold test for differential shotgun proteomics.
Bioinformatics;
28(12): 1652-4, 2012 Jun 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22539673
10.
Shape complexity in cluster analysis.
PLoS One;
18(5): e0286312, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37235568
11.
DiagnoMass: A proteomics hub for pinpointing discriminative spectral clusters.
J Proteomics;
277: 104853, 2023 04 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36804625
12.
PatternLab V Handles Multiplex Spectra in Shotgun Proteomic Searches and Increases Identification.
J Am Soc Mass Spectrom;
34(4): 794-796, 2023 Apr 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36947430
13.
Search engine processor: Filtering and organizing peptide spectrum matches.
Proteomics;
12(7): 944-9, 2012 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22311825
14.
Are gastric cancer resection margin proteomic profiles more similar to those from controls or tumors?
J Proteome Res;
11(12): 5836-42, 2012 Dec 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23145836
15.
Analyzing marginal cases in differential shotgun proteomics.
Bioinformatics;
27(2): 275-6, 2011 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21075743
16.
Quasispecies dynamics with network constraints.
J Theor Biol;
312: 114-9, 2012 Nov 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22898555
17.
Simple, efficient and thorough shotgun proteomic analysis with PatternLab V.
Nat Protoc;
17(7): 1553-1578, 2022 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35411045
18.
Can the false-discovery rate be misleading?
Proteomics;
11(20): 4105-8, 2011 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21834134
19.
XDIA: improving on the label-free data-independent analysis.
Bioinformatics;
26(6): 847-8, 2010 Mar 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20106817
20.
Interspecies evolutionary dynamics mediated by public goods in bacterial quorum sensing.
Phys Rev E;
103(1-1): 012403, 2021 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33601496