Detalles de la búsqueda
1.
Targeting dihydroceramide desaturase 1 (Des1): Syntheses of ceramide analogues with a rigid scaffold, inhibitory assays, and AlphaFold2-assisted structural insights reveal cyclopropenone PR280 as a potent inhibitor.
Bioorg Chem;
145: 107233, 2024 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38422591
2.
Multi-Responsive Eight-State Bis(acridinium-Zn(II) porphyrin) Receptor.
J Am Chem Soc;
145(19): 10691-10699, 2023 May 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37154483
3.
Extended connectivity interaction features: improving binding affinity prediction through chemical description.
Bioinformatics;
37(10): 1376-1382, 2021 06 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33226061
4.
Revealing 2-dimethylhydrazino-2-alkyl alkynyl sphingosine derivatives as sphingosine kinase 2 inhibitors: Some hints on the structural basis for selective inhibition.
Bioorg Chem;
121: 105668, 2022 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35219046
5.
Development of an Automatic Pipeline for Participation in the CELPP Challenge.
Int J Mol Sci;
23(9)2022 Apr 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35563148
6.
Discovery of an Allosteric Ligand Binding Site in SMYD3 Lysine Methyltransferase.
Chembiochem;
22(9): 1597-1608, 2021 05 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33400854
7.
Testing automatic methods to predict free binding energy of host-guest complexes in SAMPL7 challenge.
J Comput Aided Mol Des;
35(2): 209-222, 2021 02.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33464434
8.
Fragment-to-lead tailored in silico design.
Drug Discov Today Technol;
40: 44-57, 2021 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34916022
9.
Structural Stability Predicts the Binding Mode of Protein-Ligand Complexes.
J Chem Inf Model;
60(3): 1644-1651, 2020 03 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32052965
10.
Cosolvent-Based Protein Pharmacophore for Ligand Enrichment in Virtual Screening.
J Chem Inf Model;
59(8): 3572-3583, 2019 08 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31373819
11.
Detecting similar binding pockets to enable systems polypharmacology.
PLoS Comput Biol;
13(6): e1005522, 2017 Jun.
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| MEDLINE | ID: mdl-28662117
12.
Solvents to Fragments to Drugs: MD Applications in Drug Design.
Molecules;
23(12)2018 Dec 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30544890
13.
Inherent conformational flexibility of F1-ATPase α-subunit.
Biochim Biophys Acta;
1857(9): 1392-1402, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27137408
14.
LigQ: A Webserver to Select and Prepare Ligands for Virtual Screening.
J Chem Inf Model;
57(8): 1741-1746, 2017 08 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28700230
15.
Molecular Dynamics in Mixed Solvents Reveals Protein-Ligand Interactions, Improves Docking, and Allows Accurate Binding Free Energy Predictions.
J Chem Inf Model;
57(4): 846-863, 2017 04 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28318252
16.
Binding mode prediction and MD/MMPBSA-based free energy ranking for agonists of REV-ERBα/NCoR.
J Comput Aided Mol Des;
31(8): 755-775, 2017 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28712038
17.
Docking-undocking combination applied to the D3R Grand Challenge 2015.
J Comput Aided Mol Des;
30(9): 805-815, 2016 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-27709317
18.
Virtual screening: an in silico tool for interlacing the chemical universe with the proteome.
Methods;
71: 44-57, 2015 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25193260
19.
rDock: a fast, versatile and open source program for docking ligands to proteins and nucleic acids.
PLoS Comput Biol;
10(4): e1003571, 2014 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24722481
20.
VAV3 mediates resistance to breast cancer endocrine therapy.
Breast Cancer Res;
16(3): R53, 2014 May 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24886537